Evaluation of genomic imbalance in endometrial hyperplasia and carcinoma

Pełen tekst

(1)Ginekol Pol. 2014, 85, 828-832.

(2)

(3) g i n e kol og i a. Ocena niezrównoważenia genomu w przypadkach rozrostu oraz raka endometrium Evaluation of genomic imbalance in endometrial hyperplasia and carcinoma.

(4) 1

(5)

(6)

(7) 11 2,

(8)

(9) 2 ! 3"

(10) 3

(11) # $1 1. Katedra Genetyki Klinicznej i Laboratoryjnej, Zakład Genetyki Klinicznej Uniwersytetu Medycznego w Łodzi, Polska Klinika Ginekologii i Położnictwa II Katedra Ginekologii i Położnictwa Uniwersytetu Medycznego w Łodzi, Polska 3 Klinika Ginekologii Operacyjnej i Onkologicznej I Katedra Ginekologii i Położnictwa Uniwersytetu Medycznego w Łodzi, Polska 2. Streszczenie Cel pracy: Celem podjętych badań było zidentyfikowanie w grupie pacjentek z rozrostem endometrium najwcześniejszych i specyficznych zmian genetycznych, które można identyfikować z podwyższonym ryzykiem transformacji nowotworowej, a także charakterystyka zmian genetycznych związanych z rozwiniętą formą nowotworu. Materiał i metody: Badaniami objęto 44 pacjentki: w 5 przypadkach histopatologicznie nie potwierdzono cech rozrostu, w 26 przypadkach potwierdzono histopatologicznie rozrost endometrium, u 13 pacjentek zdiagnozowano raka błony śluzowej trzonu macicy. Wyniki: Badania przeprowadzono przy użyciu mikromacierzy typu custom-made 4x180K firmy BlueGnome. W przypadkach bez rozrostu zdiagnozowaliśmy zmiany o charakterze CNV’s (Copy Number Variation), które z różną częstością występują w genomie populacji osób zdrowych. Istotne niezrównoważenie genomu zostało wykryte u 26 (100 %) pacjentek z rozpoznanymi rozrostami oraz u 11 (84, 6%) pacjentek z rozpoznanym rakiem endometrium. Wykryliśmy również dotąd nieopisywane zmiany zlokalizowane w charakterystycznych regionach genomu. Wnioski: Technika aCGH jest efektywnym narzędziem do analizy aberracji chromosomowych. Badanie niestabilności chromosomowej, czyli określenie rodzaju i zakresu zmian w chromosomach, jest badaniem pozwalającym ustalić regiony krytyczne, a co za tym idzie zidentyfikować geny lub grupy genów ważne dla powstawania i rozwoju raka endometrium. W oparciu o przeprowadzone badania zaproponowaliśmy hipotetyczny model sekwencji zmian genetycznych towarzyszących wielostopniowemu procesowi transformacji nowotworowej endometrium. Schemat przedstawia Rycina 2.. Słowa kluczowe: rozrost endometrium / rak endometrium / aCGH / Adres do korespondencji: Michał Bednarek Katedra Genetyki Klinicznej i Laboratoryjnej, Zakład Genetyki Klinicznej Uniwersytetu Medycznego w Łodzi, Centrum Kliniczno-Dydaktyczne UM Polska, 92-213 Łódź, ul. Pomorska 251 tel./fax: + 42 272 57 67, e-mail: robin4307@wp.pl. 828. © Polskie Towarzystwo Ginekologiczne. Otrzymano: 22.01.2014 Zaakceptowano do druku: 19.06.2014. Nr 11/2014.

(12) Ginekol Pol. 2014, 85, 828-832. P R A C E. O R Y G I N A L N E g i n e kol og i a. Michał Bednarek et al. Ocena niezrównoważenia genomu w przypadkach rozrostu oraz raka endometrium.... Abstract Objective: The main goal of our study was to identify the earliest and specific genetic changes which could be associated with an increased risk of neoplastic transformation in a group of patients with endometrial hyperplasia. Another goal was to characterize genetic changes associated with advanced forms of cancer. Material and methods: The study involved forty-four (44) female patients, including five (5) patients with no histopathologically confirmed hyperplastic features, twenty-six (26) patients with histopathologically confirmed endometrial hyperplasia, and thirteen (13) patients with diagnosed carcinoma of the endometrium. The study was conducted using a custom-made 4x180K microarray of BlueGnome. Results: Copy number variations (CNV) were found in the cases without endometrial hyperplasia. Such changes occur with varying frequency in the genome of healthy female population. Significant genome imbalance was identified in the twenty-six (26) (100%) patients with diagnosed hyperplasia and in eleven (11) subjects (84.6%) with diagnosed endometrial cancer. Other, not yet reported, changes localized in characteristic regions of the genome were also found.. Key words: endometrial hyperplasia / endometrial carcinoma / aCGH / Wstęp. Materiał i metody. %

(13) & &' '

(14) &

(15) '

(16) $$ ($ )*$ #

(17) + ($ $ $ ' $

(18) $&

(19) #. / ($ $

(20) '

(21) 04-56

(22) 066.

(23) .%

(24) & & '&' $ & ' $) ( $

(25) $7* 80-9:. ;

(26)

(27)

(28) *

(29) &* *

(30)

(31) ($

(32) $ '

(33) *<=$*

(34) $$

(35) &

(36)

(37) &$ $ +

(38) > &'

(39) $$ $ '$

(40) & &. ' &&($05?06 $ '+@

(41) '&.!) ( '*$ *' &&060A

(42)

(43) ') ' *' &&($ 5 B 05

(44) + ' *

(45) CC. D&

(46) $ $

(47) $

(48) 0 $$ #

(49)

(50) #$ #

(51) # $ . &

(52) '+& '& &&$&

(53) $

(54) &$ .

(55) & & + *' 0A ?A.

(56) ) &

(57) $ &# @&

(58) > &# +

(59)

(60) $

(61) $$*

(62) > &'$ #

(63)

(64) & &8E-F:. ;

(65) &

(66) @ #

(67) ( '&$* * &

(68) & &

(69) $*

(70) '+($ ($

(71)

(72) '&$*

(73) $$ &

(74) & & (#

(75)

(76) ($*

(77) . ; *

(78) *

(79) )

(80) $$ ($ # $

(81) '

(82) *

(83) *

(84) & & &( (

(85) &

(86) &#*$'++$&

(87) &

(88) &($ *'+ $ . #

(89)

(90) *

(91) &( $$

(92)

(93) &#

(94) $@ $ &

(95)

(96)

(97) ( $ '+ #

(98) '$$

(99) 806:. 7 $

(100) &

(101) &&$ &'+ $$

(102) & >*&(

(103) $$ $.!)@($* ' #

(104) & '& &&$&. = *

(105) )@

(106) &$ &# $$@

(107)

(108)

(109) &

(110)

(111) +*$)+.# &(

(112) $ (#

(113) ' &&$ '

(114) + $*

(115) *

(116) &&# @$ * '

(117) $

(118) &( ( (*

(119) $ &

(120)

(121)

(122)

(123) '+ '

(124) > &'

(125) $$ $ '800:..

(126) &'EE'

(127) (

(128) $

(129)

(130) '+ *

(131) > &*

(132) & $$

(133) &

(134) *

(135) .!4 *

(136)

(137) $

(138)

(139) )

(140) .!5G $

(141) *

(142)

(143) & &.HG '

(144) & & 00'

(145) & #

(146) && $

(147) $

(148) .&( $+ $

(149) 5 '

(150) & & B &#

(151) &.H09'

(152)

(153) $

(154)

(155) )*$ '

(156) &$B

(157) )*$) *

(158) ' I0

(159) & $ G

(160) I5.7'

(161) $$*$

(162) $

(163) $ * $ $& 9F ?B *. D

(164) $+

(165) '

(166) (

(167)

(168) $ ) * $

(169) *

(170) $(

(171)

(172)

(173)

(174)

(175) $$ )*$ . !5G

(176) & $ '

(177)

(178)

(179) &$0? +' '

(180) ''&&. 7 ' $$

(181) +

(182) &' H

(183) $

(184) $ '

(185) %==J?6J06J K. # $ *

(186) > &$ '

(187) * &

(188) & $*

(189) $ &

(190) +

(191)

(192) $$ ' $&. =* '

(193) '> &

(194) *& + '& #

(195) $ & ($ L-0FGMN.* '

(196) > &

(197) $*

(198) $

(199)

(200)

(201)

(202) $

(203)

(204) *

(205) '.O

(206) ($ $ ** $(

(207) * #

(208) ) ($

(209)

(210) . < *

(211) &

(212) =P #

(213) *

(214) *+E4(.<

(215)

(216) *$*Q$

(217) '

(218) 7

(219) I

(220) *

(221)

(222) '( $$*

(223)

(224)

(225) $

(226) (

(227) $$ $800:. <=*$

(228) & +*&

(229) $+ *RQ & S

(230) *.")@

(231) <=

(232)

(233) & >& =

(234) < =<-0666. O

(235)

(236) ($

(237) $#

(238)

(239) & $

(240) $

(241) && & CitoChyp CancerET0?6Q & * I

(242) & .D

(243) $

(244) '& & $

(245)

(246) & $

(247) & Q &*

(248) .. Nr 11/2014. © Polskie Towarzystwo Ginekologiczne. 829.

(249) Ginekol Pol. 2014, 85, 828-832. P R A C E O R Y G I N A L N E ginekolog i a. Michał Bednarek et al. Ocena niezrównoważenia genomu w przypadkach rozrostu oraz raka endometrium.... Tabela I. Najczęstsze aberracje chromosomowe wykryte techniką aCGH w prezentowanym eksperymencie. Rozrost endometrium Rak endometrium. Regiony chromosomowe. bez cech atypii. atypowy. dup 14q32.33. del 15q11.2. dup/del 20q13.33. dup 5q13.2. dup/del 8p11.23. dup/del 19p13.3. dup 6q14.1. dup 12p13.31. dup 16p13.3. dup 1p34.1. del 6p21.32. dup13q14.2. dup/del 6q25.2. dup 11q13.2. dup11p15.5. dup/del 8p23.1. del 10q26.3. dup16q23.1. dup7p22.3 dup/del1p36.32 dup 8q24.3 dup 17q25.3 dup 5p15.33 Dup/del 8p12 Dup/del 17q12 dup 19q13.42. 7 ' & &

(250) $

(251) #

(252) C

(253)

(254)

(255) F66/Q &C

(256)

(257) .

(258) *

(259) ($ $

(260) # & T. I Q

(261) + ( $

(262) $

(263) & & * U *5.G.. Wyniki ! $ (

(264) $

(265)

(266) $

(267) ($

(268) $#

(269)

(270) & $'+ & &

(271) =PVLCopy Number VariationN( (#

(272) +)+ $'+ $

(273) & *' ( $. ;

(274) IW Laray Comperative Genomic HybridizationN $*

(275) $

(276) ($

(277) $#

(278)

(279) &5GL066XN'

(280)

(281)

(282) & &. ' &&$ $ 00L?EGXN'

(283)

(284)

(285) & &

(286) & &. =' ' &&$ $

(287) + IW$

(288) & &

(289) $

(290) $ * C.

(291) *

(292) + '

(293)

(294)

(295) & & & #

(296) & ($

(297) & ' &( $ '$*$

(298) @

(299) ') ' $ '+ &

(300) * 'Y *04A00.5 *'Y 0EA95.99 0509.90 GA0E.0 4A09.5. %

(301) &$( &

(302) ') ' &

(303) ($

(304) * ' *'

(305) Y J *?00.59. ='&

(306) ($

(307) $#

(308) &

(309) & $$

(310) &$

(311) & &Y J *56A09.99 J *0F09.9 0G09.9 09A0E.5 0004.4 *06A5G.9 B55.9 J *09G.95.D&

(312) $$

(313) (#

(314) +)+. D $

(315)

(316)

(317) LZ669N * #

(318) )@ & (*

(319) & & '

(320) ($ & &. 830. Rycina 1. Zależność między poziomem niezrównoważenia genomu, a nasileniem zmian architektoniki tkanki endometrium i poziomem atypii komórkowej w pięciu Q\_ZKMR ZKMTOXÔU$ <:$ \Yd\Y]^ Z\Y]^c% <:+$ \Yd\Y]^ Z\Y]^c K^cZYac% <D$ \Yd\Y]^. dŸŞYXc% <D+$ \Yd\Y]^ dŸŞYXc K^cZYac% </$ \KU OXNYWO^\S_W.

(321) ($

(322) $#

(323)

(324) &. C& '

(325) *

(326) &

(327)

(328)

(329)

(330) & & $# & &( $ '&$ $

(331) $#

(332) ($

(333) $#

(334)

(335) &. +

(336) ($

(337) $#

(338)

(339) &' *& ( * *' * '

(340) 0. <

(341) *

(342) '

(343) $

(344)

(345) ) -

(346) *$(

(347)

(348) *' 7

(349) .. © Polskie Towarzystwo Ginekologiczne. Nr 11/2014.

(350) Ginekol Pol. 2014, 85, 828-832. P R A C E. O R Y G I N A L N E g i n e kol og i a. Michał Bednarek et al. Ocena niezrównoważenia genomu w przypadkach rozrostu oraz raka endometrium.... Tabela II. Zestawienie wyników analizy niezrównoważeń genomu w rozrostach i raku endometrium uzyskanych przez różnych autorów. Autor Chromosom 1. Sonoda i wsp. 1997. Kiechle i wsp. 2000. Baloglu i wsp. 2001. Micci i wsp. 2004. Muslumanoglu i wsp. 2005. Levan i wsp. 2006. Nasze wyniki. +q. -p; +q. +q; +p. +q; +p. -p, +q. +q. +/- p36.32. +p +q. +p. 2 3 4 5. +q. +q. -q. +q. -q. +p -q. +q13.2. 6. +p; +q; -q. +q14.1. 7. +p; +q. + p22.3. + /- 8. +q; +p. +/p11.23 +/-p23.1. +q; +p. +q; +p. 8. +p. +q. +q. +q. 9 10. +q. +q. -q. +q, +p. -p; -q +p; +q. 11 12 13. +q. + p13.31. +q. + q14.2 +q32.33 +/- q11.1. 14 15 16. -q11.2 -p. +p. +p13.3. 17. -p; -q; +q. 18. +q. -q. 19. -p; -q. +p; +q. 20. -q26.3 + p15.5. -q. X. +q; +p. -q. -q. +/- p13.3 +/- q13.33. -p; -q. Y. Dyskusja !

(351) $

(352) ' $

(353)

(354)

(355) &* *

(356) '

(357) '$ '

(358) ' *)$

(359) + ($

(360) $+ '+ & & IW$ *$

(361) ($

(362) $#

(363)

(364) & &(

(365) (#

(366)

(367)

(368) .7 ($

(369)

(370) )$

(371) '& IW $

(372) &

(373) &

(374)

(375) ($ &$ $ *

(376) $#+)+& IW.L; *CCN. ($

(377) #&#*$&

(378)

(379) ($

(380) $#

(381)

(382) &

(383) ($ &&$

(384) &#*$ $*

(385)

(386)

(387) + '

(388) +#)@

(389) IW.7' '

(390)

(391) $$

(392) )@ $ $

(393) ')$-*)$ &

(394)

(395) & $ ($

(396) & &."

(397) $'+ # $04EX

(398) & &

(399) $$

(400)

(401) ($

(402) $#

(403)

(404) &. @&# )$ &# *)$')$ &

(405)

(406) &

(407) + *

(408) )+ $*

(409) $ ++

(410)

(411) @

(412) $+'+ ' #

(413)

(414) ' ' $ *

(415) $ ($ *

(416)

(417) &

(418)

(419) .

(420) *

(421)

(422)

(423) +IW$

(424) &

(425) $*$

(426) @*&

(427)

(428) &(

(429) $

(430) $ )

(431) '. ' Y 0EA95.99L06JEE55.BXN *04A00.5LFJEE56.4XN.. Nr 11/2014. D

(432) &

(433)

(434) & ' > $

(435) *) $ $

(436) &

(437)

(438) ($

(439) $#

(440)

(441) &

(442) ($ $. D$ *

(443)

(444) * ' $

(445) ' $

(446) & )$

(447) *

(448)

(449)

(450)

(451) &.

(452) > &'." &

(453) &$'+ +# $' )

(454) & & '+& $('

(455) & &. %

(456) & &&$& (

(457) ') ' *

(458) #'&

(459) 0EA95.99. "

(460) . '+& # $

(461) & &$

(462) '

(463) SIVA. I

(464)

(465)

(466)

(467) + *$ *' . [$+# + +<5B( '

(468) &

(469) TNFRL

(470)

(471) & $

(472) $$ ($N.7$ +

(473) [ &* $' *

(474) )@

(475) $

(476) $ $**

(477) &( $809:. %

(478) 04A00.5$ locus *

(479) CYFIP1.I

(480) ' U%0.CYFIP1 *' &

(481)

(482) $ * 80E:.*[$. *# \UC70 * * '&$*

(483) $$

(484)

(485) $.O

(486) #

(487) ' CYFIP1 ' $$

(488)

(489) '

(490) $$ ($

(491)

(492) $ ' $+

(493) & $

(494) &. <

(495) )$ *

(496) *[ $'+ # CYFIP1 &# $$@

(497)

(498)

(499)

(500) ' $$

(501)

(502) & &

(503) *

(504) ' &( -&( 804:.. © Polskie Towarzystwo Ginekologiczne. 831.

(505) Ginekol Pol. 2014, 85, 828-832. P R A C E O R Y G I N A L N E ginekolog i a. Michał Bednarek et al. Ocena niezrównoważenia genomu w przypadkach rozrostu oraz raka endometrium.... Rycina 2. Model akumulacji zmian genetycznych występujących w transformacji nowotworowej endometrium.. Wnioski. Piśmiennictwo. ;

(506) IW ' > $

(507) &

(508) &

(509) * ' &&$.

(510)

(511) *

(512) ) &&$ ' * )*

(513) ' &

(514) $ && '

(515) & $*'+& *@

(516)

(517) &

(518) Q$@

(519) *

(520) ($$#

(521) *$$

(522) $'

(523) & &.! $

(524)

(525)

(526) $*)&

(527) & * $

(528) '&

(529)

(530)

(531) $ +$ *

(532) $ & $

(533) > &'

(534) $$ $ '

(535) & &. & $%

(536) 5.. 1. Didkowska J, Wojciechowska U, Tarkowski W, Zatoński W. Nowotwory złośliwe w Polsce w 2006 r, Centrum Onkologii – Instytut im. M. Skłodowskiej-Curie, Warszawa. 2008. 2. Silverberg SG, Kurman RJ, Nogales F, [et al.]. Epithelial tumors and related lesions. In: Pathology and Genetics of Tumors of the Breast and Female Organs. Eds. Devilee P, Tavassoli FA. Lyon, France: IARC Press. 2003. 3. Grosman-Dziewiszek P, Dziegiel P, Zabel M. Disturbance of gene expression in endometrial cancer as therapy aim. Ginekol Pol. 2011, 82 (4), 276-280. 4. Levan K, Partheen K, Osterberg L, [et al.].Chromosomal alterations in 98 endometrioid adenocarcinomas analyzed with comparative genomic hybridization. Cytogenet Genome Res. 2006, 115 (1), 16-22. 5. Muslumanoglu HM, Oner U, Ozalp S, [et al.].Genetic imbalances in endometrial hyperplasia and endometrioid carcinoma detected by comparative genomic hybridization. Eur J Obstet Gynecol Reprod Biol. 2005, 120 (1), 107-114. 6. Baloglu H, Cannizzaro LA, Jones J, Koss LG. Atypical endometrial hyperplasia shares genomic abnormalities with endometrioid carcinoma by comparative genomic hybridization. Hum Pathol. 2001, 32 (6), 615-622. 7. Micci F, Teixeira MR, Haugom L, [et al.].Genomic aberrations in carcinomas of the uterine corpus. Genes Chromosomes Cancer. 2004, 40 (3), 229-246. 8. Sonoda G, du Manoir S, Godwin AK, [et al.]. Detection of DNA gains and losses in primary endometrial carcinomas by comparative genomic hybridization. Genes Chromosomes Cancer. 1997, 18 (2), 115-125. 9. Kiechle M, Hinrichs M, Jacobsen A, [et al.]. Genetic imbalances in precursor lesions of endometrial cancer detected by comparative genomic hybridization. Am J Pathol. 2000, 156 (6), 1827-1833.. Oświadczenie autorów: 1. Michał Bednarek – autor koncepcji i założeń pracy, przygotowanie manuskryptu i piśmiennictwa, wykonanie badań laboratoryjnych. 2. Maria Constantinou – opracowanie wyników badań. 3. Łukasz Kępczyński – analiza statystyczna wyników. 4. Agata Shiar Kassassir – zebranie materiału. 5. Anna Sobczuk – zebranie materiału. 6. Maria Wieszczycka – zebranie materiału. 7. Jacek Suzin – zebranie materiału. 8. Bogdan Kałużewski – współautor tekstu pracy, ostateczna weryfikacja I akceptacja manuskryptu.. 10. Shaffer LG, McGowan-Jordan J, Schmid M. ISCN 2013: An International System for Human Cytogenetic Nomenclature. 2013. Karger Publishers, 15 paź 2012. 11. Gisselsson D. Tumour morphology-interplay between chromosome aberrations and founder cell differentiation. Histol Histopathol. 2002, 17 (4), 1207-1212. 12. Constantinou M, Bednarek M, Zając E, [et al.]. Wykorzystanie technik genomowej hybrydyzacji porównawczej do chromosomu (CGH) i mikromacierzy (aCGH) w świetle 10 letnich badań własnych. Red. Kocki J. Kazuistyka wieku rozwojowego. Symptomatologia i diagnostyka. Lublin: Polihymnia. 2010, 69-122. 13. Prasad KV, Ao Z, Yoon Y, [et al.]. CD27, a member of the tumor necrosis factor receptor family, induces apoptosis and binds to Siva, a proapoptotic protein. Proc Natl Acad Sci U S A. 1997, 94 (12), 6346-6351. 14. Machesky LM, Tang HR. Actin-based protrusions: promoters or inhibitors of cancer invasion? Cancer Cell. 2009, 16 (1), 5-7. 15. Silva JM, Ezhkova E, Silva J, [et al.]. Cyfip1 is a putative invasion suppressor in epithelial cancers. Cell. 2009, 137 (6), 1047-1061.. Źródło finansowania: ³. część projektu finansowana z grantu promotorskiego MNiSW nr N N407 687440 ³. część projektu finansowana była przez firmę “Genos” - członka Polskiej Platformy Technologicznej Innowacyjnej Medycyny, Narodowego Centrum Badań i Rozwoju. Konflikt interesów: +_^Y\dc XSO dQ¨K]dKT UYX»SU^_ SXÔ\O]éa Y\Kd XSO Y^\dcWKVS ŞKNXOQY wynagrodzenia związanego z powstawaniem pracy.. 832. © Polskie Towarzystwo Ginekologiczne. Nr 11/2014.

(537)