Podstawy biologii
Informacja, struktura i metabolizm.
Informacje
Kontakt:
Paweł Golik
Instytut Genetyki i Biotechnologii, Pawińskiego 5A pgolik@igib.uw.edu.pl
Informacje, materiały:
http://www.igib.uw.edu.pl/
Lektury
Dla zainteresowanych
Zaliczenie
•
Esej na jeden z zaproponowanych tematów•
Wizje ewolucji w literaturze, sztuce, kulturze.•
Np. K. Vonnegut “Galapagos”, W. Golding “Spadkobiercy” itp.•
Czy nauczanie o ewolucji jest zagrożeniem dla moralności?•
Inny temat łączący tematykę zajęć zzainteresowaniami autora - interdyscyplinarny
Dlaczego ewolucja?
•
Podstawa nauk biologicznych, biomedycznych, itp.•
Piękno teorii•
Konsekwencje dla światopoglądu•
pochodzenie człowieka•
miejsce człowieka w świecie przyrody•
konflikt z religiami•
KontrowersjeKreacjoniści są wśród nas
Czym jest życie?
•
Struktura•
Metabolizm•
Informacja (replikacja)Właściwości emergentne
•
System jako całość ma właściwości nie będące sumą właściwościelementów składowych
•
Złożoność powstaje z licznych interakcjiprostszych składowych
Henrietta Lacks 1920-1951
Struktura hierarchiczna i kombinatoryka
•
DNA/RNA – 4 typy nukleotydów•
Białka – 20 aminokwasówHierarchia w strukturze białek
•
W budowie białek wyróżnić można“klocki” o
hierarchicznej strukturze
•
Fałdy, motywy, domenyKombinatoryka
Różnorodność pochodzi z kombinacji ograniczonej liczby elementów składowych
Metabolizm
•
Organizmy żywe są układami otwartymi termodynamicznie•
Dopływ energii z zewnątrz zapewniautrzymanie organizacji
Metabolizm
http://www.expasy.ch
Złożone szlaki przemiany energii i materii
http://biochemical-pathways.com
Podstawowe pojęcia
•
Informacja genetycznaPrzekazywana z podziałem komórki informacja umożliwiająca odtworzenie całej struktury komórkowej.
•
Materiał genetycznyNośnik fizyczny informacji genetycznej. W komórkach jest nim DNA.
•
Kod genetycznyMechanizm przełożenia informacji genetycznej zapisanej w sekwencjach DNA i RNA na sekwencję aminokwasową białka.
Zasadniczo taki sam u wszystkich organizmów żywych.
Mylenie pojęć
Informacja w biologii
Informacja genetyczna nie jest gotowym opisem, jest przepisem
Podstawowe pojęcia
•
Gen•
Podstawowa jednostka dziedziczności•
“Jeden gen, jedna cecha”?•
“Jeden gen, jeden enzym”?•
“Jeden gen, jeden produkt molekularny (białko/RNA)”?•
Allel•
Konkretny wariant danego genu•
Genom•
Całokształt informacji genetycznej organizmu•
Transkryptom, proteom, metabolom interaktom (i inne “–omy”)Podstawowe pojęcia genetyki
•
Genotyp•
Informacja genetyczna organizmu w postaci konkretnych alleli wszystkich genów•
Fenotyp•
Zbiór obserwowalnych cech organizmu•
Produkt interakcji genotypu i środowiskaZasadnicze pytanie genetyki
•
Jak genotyp determinuje fenotyp?Uniwersalność życia
•
Podstawowe mechanizmy są takie same u wszystkich znanych organizmów•
budowa DNA i RNA•
kod genetyczny•
repertuar aminokwasów budujących białka•
podstawy metabolizmu•
budowa błon komórkowych•
Wyjaśnienie – pochodzą od jednego wspólnego przodka wszystkich żyjących obecnie organizmów“Les éléments vitaux étant de nature semblable dans tous les êtres vivants, ils sont soumis aux
mêmes lois organiques...”
“Podstawowe jednostki życia, mając u wszystkich żyjących istot podobną naturę, rządzone są tymi
samymi prawami organicznymi...”
Claude BERNARD (1813-1878)