Dr hab. Jerzy Rotko jest profesorem Instytutu Nauk Prawnych PAN w Zakładzie Zagadnień Prawnych Kształtowania i Ochrony Środowiska (z siedzibą we Wrocławiu).
Przedmiotem jego zainteresowań naukowych jest prawo ochrony środowiska, zwłaszcza prawo wodne oraz prawo techniczne.
W dorobku autora jest blisko sto publikacji naukowych. Ostatnio opublikowane prace to:
Kodeksowe pozwolenie zintegrowane a sektorowe pozwolenie wodnoprawne – doświadczenia niemieckie, Problem zanieczyszczenia wód śródlądowych substancjami chemicznymi w świetle prawa europejskiego oraz prawa krajowego – uwagi krytyczne, Przyszłość konwencjonalnych elektrowni węglowych w świetle prawa międzynarodowego i europejskiego.