• Nie Znaleziono Wyników

Expression of melatonin receptors genes and genes associated with regulation of their activity in endometrial cancer

N/A
N/A
Protected

Academic year: 2022

Share "Expression of melatonin receptors genes and genes associated with regulation of their activity in endometrial cancer"

Copied!
8
0
0

Pełen tekst

(1) 

(2)  

(3) 

(4) . P R A C E O R Y G I N A L N E ginekolog i a. Ekspresja genów receptorów melatoninowych i genów związanych z regulacją ich aktywności w gruczolakoraku endometrium Expression of melatonin receptors genes and genes associated with regulation of their activity in endometrial cancer. Andrzej Witek1

(5)  

(6) 1

(7) 

(8) 1 

(9) 

(10) 2

(11)   

(12) 2

(13) 

(14)   2,  

(15)  

(16) ! "2#$

(17) 

(18)  % 2& 

(19) 

(20)  2. 1 2. Katedra i Klinika Ginekologii i Położnictwa, Wydział Lekarski w Katowicach, Śląski Uniwersytet Medyczny, Katowice, Polska Katedra i Zakład Biologii Molekularnej, Wydział Farmaceutyczny z Oddziałem Medycyny Laboratoryjnej w Sosnowcu, Śląski Uniwersytet Medyczny, Katowice, Polska. Streszczenie Cel pracy: Celem pracy była ocena aktywności transkrypcyjnej genów kodujących receptory melatoninowe oraz genów zaangażowanych w ich regulację w gruczolakoraku endometrium pod kątem poszukiwania molekularnych markerów diagnostycznych i prognostycznych tego nowotworu. Materiał i metody: Materiał do badań stanowiły wycinki gruczolakoraka endometrium typu endometrioidalnego w stopniu histologicznego zróżnicowania G1, G2, G3 oraz endometrium prawidłowego. Badania molekularne wykonano u 37 kobiet. Po izolacji RNA z tkanek techniką mikromacierzy oligonukleotydowych HG-U133A (Affymetrix) spośród 22 283 ID mRNA wyznaczono profil stężenia mRNA genów związanych z aktywnością receptorów melatoninowych. Metodą qRT-PCR oceniono zmiany aktywności transkrypcyjnej genów receptorów melatoninowych w wycinkach gruczolakoraka w porównaniu do endometrium prawidłowego. Wyniki: Analiza transkryptomów metodą mikromacierzy ekspresyjnych (Affymetrix) pozwoliła na wytypowanie 18 ID mRNA dla genów związanych z aktywnością receptorów melatoninowych różnicujących raka endometrium od kontroli, przy założeniu, że wartość p<0,05 oraz FC(log2)>1,5. Wśród genów specyficznie różnicujących raka są: w stopniu G2- ASMTL, GNA11, PER2, PTGDS oraz w stopnia G3- GNA12, GNA11. Wyciszenie genu kodującego białko RGS4, regulujące czas i nasilenie przekazywania sygnału przy udziale białka G (negatywnego regulatora) obserwowano we wszystkich wycinkach raka, niezależnie od stopnia zróżnicowania histologicznego.. Adres do korespondencji: Agnieszka Jęda Katedra i Klinika Ginekologii i Położnictwa, Wydział Lekarski w Katowicach, Śląski Uniwersytet Medyczny, Katowice Polska, Katowice, ul. Medyków 14 Tel./fax.: +48 32 7894731-752 e-mail: ajeda@mp.pl. 248. © Polskie Towarzystwo Ginekologiczne. Otrzymano: 07.09.2014 Zaakceptowano do druku: 14.12.2014. Nr 4/2015.

(21)  

(22)  

(23) 

(24) . P R A C E. O R Y G I N A L N E g i n e kol og i a. Andrzej Witek, et al. Ekspresja genów receptorów melatoninowych i genów związanych z regulacją ich aktywności w gruczolakoraku endometrium.. Wnioski: Profil stężenia mRNA genów uczestniczących w regulacji aktywności biologicznej receptorów melatoninowych zależy od stopnia zróżnicowania histologicznego gruczolakoraka endometrium i może stanowić uzupełniający marker diagnostyczny i prognostyczny raka endometrium. Istotne statystycznie obniżenie ekspresji genów zaangażowanych w proces biosyntezy melatoniny (ASMTL) oraz genów kodujących białka związane z transdukcją sygnału receptorów melatoninowych (GNA11, GNA12, RTGS4, HTR2B i  GNRH2), mogą stanowić obiecujące ogniwo w podjęciu nowych terapeutycznych rozwiązań w leczeniu gruczolakoraka endometrium.. Słowa kluczowe: melatonina / receptory melatoninowe / gruczolakorak endometrium / /   

(25)   / estrogeny /. Abstract Objectives: The aim of the study was to evaluate transcription activity of melatonin receptors and genes associated with regulation of their activity in endometrial adenocarcinoma to identify probable diagnostic and prognostic molecular markers. Material and methods: The material included endometrial adenocarcinoma tissue samples of histopathological grades G1, G2, G3, and normal endometrium. The molecular analysis was performed on 37 patient samples. Total RNA was extracted and used for the microarray HG-U133A analysis. Among 22 283 ID mRNA, only entities of genes associated with regulation of melatonin receptors activity were selected. qRT-PCR was employed for validation, what allowed to compare melatonin receptor genes activation in endometrial cancer tissues to the normal endometrium. Results: The results of the microarray experiments showed that only 18 ID mRNA were differential in endometrial cancer samples as compared to the control at p-value<0.05 and FC(log2)>1.5. These genes were identified as differentially expressed in grade G2- ASMTL, GNA11, PER2, PTGDS and in grade G3- GNAI2, GNA11. Silencing of RGS4 encoding RGP4, which regulates signal transmission by G protein, was observed in all cancer groups, independently of the histopathological grade. Conclusions: The profile expression of genes associated with regulation of melatonin receptors activity was different and dependent on the histopathological grade of endometrial cancer and can be an additional diagnostic and prognostic marker. Statistically significant was the down-regulation of melatonin biosynthesis genes (ASMTL) and melatonin signal transmitters (GNA11, GNA12, RTGS. Key words: melatonin / melatonin receptors / endometrial adenocarcinoma / / estrogen-dependent malignancies / estrogens /. Wstęp '

(26)   (% )

(27)  

(28)  *  

(29)  %   

(30) 

(31)

(32) $$)  

(33) 

(34) %

(35) +-./#

(36) 

(37)  "0$  

(38) $ ( 

(39) 

(40)   

(41)  (% %

(42) "3 

(43) 

(44) $

(45) 

(46) $$$) 

(47) )3)  $%

(48) 

(49) +-./4 3* *%

(50)   33   % 35

(51) ) $( 635 

(52) 7$

(53)  

(54) 

(55) 

(56) $ (%6  35 

(57) 7/8

(58) $ 

(59) $

(60)   $

(61)   

(62) 

(63) ) %)3

(64)     %  $ $

(65) 

(66) % $

(67) 

(68) 

(69) 3  

(70) ) % *%

(71) */ 8 %*  

(72) $

(73) %$

(74) $

(75) %

(76) %

(77) 35

(78) ) $

(79)  % 

(80)    $(  %%3 

(81) %3

(82) %  3$%

(83) . )* " $

(84) 

(85)   ) 35

(86) ) $(  !9:  %

(87)   

(88) $ 3% 

(89) 

(90)  3

(91)    (* %

(92) %   

(93)   $

(94)  $

(95) )* %*    

(96)  $ 3%  $( %) 

(97)    +;./   3

(98) ) %

(99) ) 

(100)  3

(101) %3

(102)  % %

(103) %  $

(104)   $"%0 %   

(105) 

(106)   $ )

(107)   

(108) ) 

(109) $)*) 35

(110) )  %

(111) ) 3 3 ) $( 

(112) "$(%+<./. Nr 4/2015. 

(113) 

(114)  6=$ >

(115) 3

(116) $

(117) 7 3 

(118) %% $ %%

(119) 

(120)  (% 3      )  

(121) %

(122) 

(123)  %5 )$ ?$$ $@ +=./ B   

(124) 

(125) $(% 3 

(126) )*

(127)  $%5 $

(128) )  3  

(129)  6

(130)  $  

(131) 

(132) 7  3 %

(133)  ) 3    6

(134)  $ 

(135) 

(136) 

(137) 7 +C./ 

(138) 

(139) 

(140)  3 3%

(141)   

(142)   $(  (% 3% ( % D#-: %

(143)

(144)  " $

(145) 

(146)  )  3 )   )*$D'E+:./B% (%"  %*   $

(147)    

(148) $ 3%$ 33   0 3(% $

(149) %% $(

(150) 

(151) 

(152) % 3%

(153) 3 (% %%3

(154) 

(155) +FG./ H 

(156) 

(157) $

(158) )  %*

(159)   3$ 

(160)  %

(161) $$ %$3

(162) $$

(163)  %$

(164) %

(165) )*3(%)*%

(166) "*3  ''I'J'6

(167) /Retinoid Orphan Receptors/ Retinoid Z Receptors7 

(168)  

(169)    3%) +K./ JL %

(170)  %

(171) 3%3(%$

(172) #-#F

(173) 

(174)  L %

(175) 

(176)  3(% 3 " 

(177) 

(178) $D 6

(179)  

(180) DB!'7/8(3(%#-%("

(181)  % 333(%M#-#-#-!+-N./J

(182)  3%$3)  O

(183) 

(184) D3#-

(185) $)*

(186) %0 

(187) 

(188) %) $)

(189) )*0%3 %

(190)  % $(B)*

(191) %0%

(192)  

(193) . © Polskie Towarzystwo Ginekologiczne. 249.

(194)  

(195)  

(196) 

(197) . P R A C E O R Y G I N A L N E ginekolog i a. Andrzej Witek, et al. Ekspresja genów receptorów melatoninowych i genów związanych z regulacją ich aktywności w gruczolakoraku endometrium.. 

(198)  %6BP!BPBP7/8   %) . $

(199)  3 $ 5 5%

(200) 

(201)    (% 

(202)  3) !'46

(203) /cAMP Response Element-Binding7 3 ) 3 L (% )*

(204) 

(205) * 

(206) %3 3 5

(207) )

(208)  ("%

(209) 

(210) $

(211) ) $( /B3   $

(212)  $$

(213) 

(214) %%

(215)  

(216) 

(217) 

(218) $)*35 

(219) ) $( 

(220) 

(221) "  

(222) %

(223) ) 3 )% (%"3 

(224) %))  

(225)   

(226) 

(227) 

(228) +--./ H 

(229) 

(230) $

(231) 

(232)  

(233) 

(234)   ) 

(235)   (%

(236)  %()%%(% 

(237) "$"

(238) %)

(239)  0 %

(240) )* 

(241)  $

(242)  $(%M 3 3   

(243) %* 

(244) ) 3% ( 3 

(245) 

(246) 

(247) 3%

(248)   "

(249) 3 $ *"* (% 3 )

(250)   %$

(251) 3(% %64'

(252) /Selective Estrogen Receptor Modulator7)

(253)   %  $

(254)   $(% $

(255)  $  (% 644

(256) / Selective Estrogen Enzyme Modulator7+<./8

(257) ") 3  

(258)  %( 

(259) 

(260) 

(261) $

(262)  )*%%

(263) )* 

(264) %

(265) )$

(266) " 

(267) (% 

(268) %$

(269)   (%%%%

(270)  

(271) "/B

(272) %3 %

(273) )$  

(274) %

(275) 

(276)  3$  

(277) $ 3 

(278)  

(279)   %$

(280) %3

(281) )* 

(282) 3 % 

(283) %) $

(284) ) "

(285) %%* $( %B

(286) 

(287) %3 %$

(288) 

(289) %%* $( % $3 

(290) $. %

(291) 3$6!

(292) FQI!

(293) 7+-F./ )*%  3$(%

(294) $

(295) "$ 

(296)

(297) $ 

(298)  3  

(299)  *3)

(300) 

(301) 

(302) R

(303) *$

(304)  % 

(305) 

(306) $$/8

(307) 

(308) $"  

(309) 0%   

(310) 

(311)   %

(312) 

(313)  (%  %

(314) $

(315)   $

(316)  

(317) 

(318) )*

(319)   

(320) $

(321)   $(  %%%+-;./. Cel pracy !$3

(322) 

(323) 

(324) 

(325) %

(326)  3))(% )* 3 $

(327) % 

(328)  (%

(329)

(330) 

(331) "%

(332)  %

(333) )% 

(334) 

(335) $$3 $

(336) 3 *$3  %

(337) 

(338) $ 

(339) $

(340)   (%

(341)   3  %%/. Materiały i metody 

(342) 

(343) $ ) 3 ;:    % P

(344)   PD B"%

(345) &%P

(346) %

(347)  ( % 

(348) 3

(349) )  $

(350)  %  

(351) 3

(352) 

(353)  */3

(354) $5 )3

(355) .  

(356)  5

(357) $ $$   $

(358)     

(359)  % 

(360) 

(361) / H 

(362) 3 

(363) 3 

(364) 

(365) R %*   ( %  

(366) 

(367) 

(368)  3

(369) $5  %

(370) %

(371)  3

(372) %% $$ *S  

(373) 

(374)

(375)   $$ 3 $

(376) / 

(377)  )* 3R     ("%

(378) 

(379)  

(380) 

(381)

(382) $$% $33) 

(383) 

(384) 3

(385) 

(386)  %    % % :3 3

(387)  (% % 3 D- -- % DF  = % D;/ D3 3(%

(388) % * 

(389)  %-<  ( % 3

(390) %%$$ % 5

(391)  35

(392) ))/ >

(393)  

(394) 

(395) 

(396)   

(397)   P$ )  )T* &%  %P

(398) %

(399)  6P>8INNFFIP-IG:I-F7/ B  

(400) ) 

(401)  % '>  % (% $$. 

(402)  %

(403) $  (%#'UJV®6UXV5#. 250.   P

(404) 5

(405)  &7   3 $ 3

(406) / '>   

(407)   

(408) %$ '>

(409) 9 H

(410)    P 6Y

(411) D$>$7

(412) 

(413) 3 

(414) 

(415)  %'> 3

(416) %

(417)   %)  )

(418) %)/  $

(419)  '>  $

(420) *  % 

(421)  

(422)  

(423)  3$(%  * $  $

(424)    3 ) ED&-;; 655$Z U/ P

(425) 5 

(426)  &7     )* 3

(427)   $* ['#B!'/  $

(428) %  3$$

(429)  %$

(430)  %

(431)  %3

(432) $RMA6

(433) /Robust Multichip Average73

(434) $

(435)  3  

(436)  

(437) $ $ %

(438)  

(439)  \ ) $'>627

(440) 

(441) 3%3

(442) $Gene Spring 11.5 (Agilent Technologies, CA) %3%

(443)   (")* %   

(444) 

(445)

(446)  $$ % 3 ("%

(447) 

(448)      D- DF  D;    

(449) 

(450)  

(451) wariancji )  %$  $>] 6

(452) / analysis of variance7 33

(453) % *)

(454) $E

(455)  %  3(%

(456) Rpost-hoc# 

(457) (%" 33

(458) % *)

(459) $ E/

(460)   3$$

(461)  %

(462) R  %%

(463) $ 

(464) 

(465) $]

(466)  %

(467) )* 3L 0 $'> % ("%

(468)  % (%  

(469) 

(470)

(471)   / 8

(472) 

(473) )  3$ $

(474)  % 3 3%

(475)   $ * ['#B!' 6

(476) / Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction7 

(477)  $'> 3(% $

(478) % #>'- #>'-

(479)  )^DBHE6 

(480) 

(481)  ;5 5%7/ '

(482) ) 3%

(483)  . 

(484)  %

(485) $  

(486)   %) 3_ H> 4 [H6 ' 

(487) &7/H

(488) 

(489)  %   

(490)    

(491) %  (%Y

(492) #®B'#B!'P6Y

(493)  U/>$7

(494)  

(495) (%#

(496) [

(497) ®D4Z3 

(498)   633  $ &7ME NN-K==C:

(499) $'>#>'-` E NN-:;:K<

(500) $'>#>'-

(501) E KKKKKKN=

(502) $'> DBHE/ 8 0  $

(503) 

(504) $3$(% 

(505)  #>'- #>'-DBHE% 

(506) 3%CK3 G=3 -FF3 / 8

(507)   $  ['#B!'M ;N $ $3/ =Na! -N $/ $3/K=a!<N 6-=  $3/K<!-$$3/CNa!7 -N$$3/:Fa!/8 

(508) 

(509) %0

(510)  3)

(511) 

(512) 

(513)  (% )*3

(514) $

(515) %    ) DBHE 

(516) 

(517) 

(518)  %

(519) 

(520)  3

(521) $$ '4#FNNKYUD4>+-<./B

(522) $3

(523)  

(524) $3

(525)  %

(526) 3  B5

(527) 5\

(528) 6FNNF76  

(529)   Pair Wise Fixed Reallocation Randomisation Test©).. Wyniki ! 0  3$

(530) * 3

(531)  % 

(532)  % F 

(533) 3

(534) / 8 3% $ 

(535) 3 3 3%

(536)  

(537) 

(538)   3(%

(539) % * 

(540)  3$(% % 

(541)   $* $ $

(542)    3 )655$Z7/>

(543) 33 3%

(544)  %

(545) 

(546) )  3$$

(547)  % *['#B!'/>

(548) 3 

(549) %

(550)  

(551) >55Z# 3(FFFG;UH$'> 

(552)  %

(553) 

(554)  $ $

(555)   ED&-;; %3%

(556)  CC UH $'> (% 3(% $

(557) % 

(558)  $'> (% %*

(559) . 

(560) )*

(561) %3(%$

(562) %/ B

(563) 3

(564) )$ $

(565)  

(566) 

(567)  3(%

(568) % )  3R ("%

(569) 

(570) 3$ 3

(571) $

(572)  3$(%  

(573) 

(574)

(575)  $$ % 3 ("%

(576) 

(577)      D- DF  D;  / J

(578) $0 

(579)   *  %%

(580) ("$ 3L

(581) $ "R$'>  

(582)  3 

(583) % % (%   )  % >] 6

(584) / analysis of variance7 

(585)    %  3(%

(586) R. © Polskie Towarzystwo Ginekologiczne. Nr 4/2015.

(587)  

(588)  

(589) 

(590) . P R A C E. O R Y G I N A L N E g i n e kol og i a. Andrzej Witek, et al. Ekspresja genów receptorów melatoninowych i genów związanych z regulacją ich aktywności w gruczolakoraku endometrium.. post-hoc # 

(591)   33

(592) % * )

(593) $E 6#

(594) 

(595)  U7 

(596)  % 3(%

(597) Rpost-hoc# 

(598)  33

(599) % * )

(600) $E6#

(601) 

(602) UU7/

(603) 

(604) %

(605) 

(606) ) $> ] 33

(607) % *)

(608) $E%

(609) )" 3CCUH $'> %*

(610)  

(611) %* 3(% $

(612) % -G UH $'> (") 3(%%

(613)  3 

(614)  3$(% 3 

(615) ""3bNN=6#

(616) 

(617) U'

(618) -7/8

(619)  

(620)    $ (%("%

(621) 

(622) 3

(623)  3$(%33   "

(624) %

(625) 3

(626) 

(627) $?3@%

(628) 3bNNF3bNNN-  

(629) UH$'>(")* $)

(630)  -:UH$'> ;UH$'>6#

(631) 

(632) U7/ H

(633)  %3%

(634)  -G UH $'> 63bNN=7 % 3

(635) $ D 3 %%

(636)  ?$

(637) 3 *

(638) @ 

(639) )* 3L "

(640) $'>

(641) 

(642)   

(643) 

(644) ") 3(%%

(645)  3 

(646)  3$(% 6'

(647)  -7/ 

(648) %

(649)  "(

(650)  3%

(651) 

(652)  %

(653)  ) 

(654) (%\ )$'>/>

(655) $

(656) %   3 $ $'> % 3(%

(657)   %

(658)  ) 3%). $

(659)  

(660) % %    %

(661)  $)  3  $ $'> %   

(662) % 

(663) 

(664) %)/  $

(665)  %  %

(666) )*"3L "

(667) $'>3(%$

(668) % $'>(%   *%

(669) % ).

(670) " 3

(671)  ("%

(672) 

(673)    

(674) 

(675)

(676)  $$

(677) "%3(% %*

(678)  "

(679) $ 

(680) %$ 3(% $

(681) % $) )

(682)  %

(683) 

(684) 

(685) %

(686)  3))%

(687)  %  $ (" %

(688) 

(689)   

(690)

(691) / 8 )$ 

(692) 3 

(693) 

(694) R 3 3%

(695)  

(696) 

(697)    $ % 3(%

(698) R3 # 

(699)  ( %

(700) 3. )

(701) 

(702)   3(%

(703) % ) %

(704) )*   3 

(705) % UH $'> (")*  * 3 % (%  

(706)  

(707)

(708)  6#

(709) 

(710) UU7/ $

(711) % %

(712) )*".  3 -G UH $'> (")* %   

(713) 

(714)

(715)   % 

(716)  )  %$ $>] 3 %

(717) (")*)3bNN=

(718) PX D- FUH$'>  

(719)    

(720) $ 6D>'EF  'D<7/ H

(721)  P X  DF ^--UH$'>

(722) PX D;CUH$'>6#

(723) 

(724) UU7/B   )*3% 

(725) 3

(726)  %3%

(727) $'>(")*  

(728) 

(729)

(730) $$  * 3L  

(731)  )) 3(%%

(732) 3% (%

(733)

(734)  % %

(735)  

(736) 

(737) $ ]

(738)  6/F 

(739) /UUU7/  $

(740)  %  %

(741) )*

(742)  3L $'>(")*PX D-/>

(743)  $

(744)  %(%3%

(745) $'>D>'EF6

(746) /Gonadotropin-releasing hormone 27(")(%"% PX DF 

(747) 'D<6

(748) /Regulator of G-Protein Signalling 4)(")  

(749) 

(750)

(751) $$ 

(752) " 3

(753) .

(754)

(755) %

(756)  %

(757) 

(758) 6#

(759) 

(760) UUU'

(761) F7/3(--$'>(" )*DF ^CUH$'>)  3L   

(762) PX DF6#

(763) 

(764) UUU'

(765) F7/>

(766) $

(767) ;$'>(" )*(%"PX D;6#

(768) 

(769) UUU'

(770) F7/*E#'F6

(771) / 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 2B, G protein-coupled7 

(772) % 5$$'>#V6

(773) / acetylserotonin O-methyltransferase-like7 6#

(774) 

(775)  UUU7/ V 

(776)  $'> (")*  

(777) 

(778)

(779) $$ PX D;) $)

(780)  % 3(%

(781)   P X  DF  %  C $'> % $   F $'> * 3L  

(782)  P X  D;/ *   )* 

(783) 

(784) DMD>--D>-F6guanine nucleotide binding protein (G protein), alpha)  3 

(785) )* 

(786)     

(787)  

(788)   3

(789) %

(790) ) 3(% $

(791) % 6#

(792) 

(793) UUU7/. Nr 4/2015. Rycina 1. Mapy intensywności sygnałów fluorescencji ( ang.heatmap) obrazujące stężenie 18 ID mRNA genów związanych z aktywnością melatoniny różnicujących gruczolakoraka endometrium w stopniu G1,G2 i G3 w porównaniu do kontroli K (kolor niebieski-najniższe wartości, kolor czerwony – najwyższe wartości sygnałów fluorescencji).. Rycina 2. Diagram Venna grupujący mRNA wytypowane testem post-hoc Tukeya z poprawką Benjamini-Hochberg – po teście jednoczynnikowym ANOVA w zależności od specyficzności różnicowania grup transkryptomów endometrium ( dla p <0,05): K vs G1 = 2 mRNA; K vs G2 = 11 mRNA ; K vs G3 = 6 mRNA. Objaśnienia: G1, G2, G3-stopnie histopatologicznego zróżnicowania gruczolakoraka endometrium; K- grupa kontrolna (endometrium prawidłowe); ID- numer identyfikacyjny sondy na mikromacierzy HG-U133A.. 8

(794) 

(795) )  3$ $

(796)  % 3 3%

(797)   $* ['#B!'/ 

(798)  (" %

(799) % 

(800)  3 )) (% )* 3 $

(801)  #- 33 6#>'-76#>'-7%%

(802) 

(803)

(804) $$  ("$ 3 % 6D-D;7 %    

(805)    $$  $ %%%/ %  %    3 )  

(806)  3

(807)  #>'- % %    3

(808)  %  

(809) 

(810)

(811)  )

(812) "  $

(813)   %

(814)

(815)  ) 

(816) $ 

(817)   )3 

(818) "" %

(819) 03bNN=/. © Polskie Towarzystwo Ginekologiczne. 251.

(820)  

(821)  

(822) 

(823) . P R A C E O R Y G I N A L N E ginekolog i a. Andrzej Witek, et al. Ekspresja genów receptorów melatoninowych i genów związanych z regulacją ich aktywności w gruczolakoraku endometrium.. Tabe l a I . Liczba ID mRNA związanych z aktywnością melatoniny różnicujących grupy transkryptomów gruczolakoraka endometrium od endometrium prawidłowego w zależności od kryterium siły różnicowania- wartości p wyznaczonej jednoczynnikowym testem ANOVA z korekcją Benjamini-Hochberg.. p Liczba ID mRNA. 66. p<0,05. p<0,02. p<0,01. p<0,005. p<0,001. 18. 17. 11. 8. 3. Ta be l a I I . Wynik testu wielokrotnych porównań post-hoc Tukeya wskazujący liczbę ID mRNA różnicujących porównywalne grupy transkryptomów. Kolorem szarym zaznaczono liczbę ID mRNA dla różnicowania grup transkryptomów. Objaśnienia: G1, G2, G3-stopnie histopatologicznego zróżnicowania gruczolakoraka endometrium; K- grupa kontrolna (endometrium prawidłowe); ID- numer identyfikacyjny sondy na mikromacierzy HG-U133A.. Grupa transkryptomów. K. G1. G2. G3. K. 18. 2. 11. 6. G1. 16. 18. 9. 4. G2. 7. 9. 18. 5. G3. 12. 11. 13. 18. Tabe l a I I I . Legenda do diagramu Venna wskazującego specyficzność ID mRNA w różnicowaniu grup transkryptomów G1, G2 i G3 gruczolakoraka endometrium w odniesieniu do kontroli K wyznaczonych na podstawie analizy wariancji ANOVA i testu post-hoc Tukeya z poprawka Benjamini-Hochberg. Objaśnienia: G1, G2, G3 – stopnie histopatologicznego zróżnicowania gruczolakoraka endometrium; K – grupa kontrolna (endometrium prawidłowe); ID – numer identyfikacyjny zestawu sond na mikromacierzy komplementarnych do określonego mRNA; ?– obniżenie ekspresji.. Grupy porównywalnych tramskryptomów. Liczba ID mRNA   

(824). ID. G1 vs K G2 vs K. 1. 208519_x_at. GNRH2. Gonadotropin-releasing hormone 2. . 1. 204339_s_at. RGS4. Regulator of G-Protein Signalling 4. . 36553_at. ASMTL. acetylserotonin O-methyltransferase-like. . 40562_at. GNA11. guanine nucleotide binding protein (G protein), alpha 11. . 564_at. GNA11. guanine nucleotide binding protein (G protein), alpha 11. . Symbol genu. Poziom   . G1vs K G2 vs K G3 vs K. G2 vs K. G3 vs K. G2 vs K G3 vs K. 252. 6. 205251_at. PER2. period circadian clock2. . 211748_x_at. PTGDS. prostaglandin D2 synthase 21kDa. . 212187_x_at. PTGDS. prostaglandin D2 synthase 21kDa. . 201040_at. GNAI2. guanine nucleotide binding protein (G protein), alpha 12. . 214679_x_at. GNA11. guanine nucleotide binding protein (G protein), alpha 11. . 36554_at. ASMTL. acetylserotonin O-methyltransferase-like). . 206638_at. HTR2B. 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 2B, G protein-coupled. . 209394_at. ASMTL. acetylserotonin O-methyltransferase-like). . 2. 3. © Polskie Towarzystwo Ginekologiczne. Nr 4/2015.

(825)  

(826)  

(827) 

(828)  . P R A C E. O R Y G I N A L N E g i n e kol og i a. Andrzej Witek, et al. Ekspresja genów receptorów melatoninowych i genów związanych z regulacją ich aktywności w gruczolakoraku endometrium.. Tab e la I V. Porównanie aktywności transkrypcyjnej receptorów melatoninowych MTNR1A i MTNR1B w wycinkach gruczolakoraka endometrium w odniesieniu do kontroli, gdy wyniki są normalizowane względem GAPDH w programie REST. Objaśnienia: X = G1, G2 lub G3 – stopnie histopatologicznego zróżnicowania gruczolakoraka endometrium; p – wartość wskazująca siłę różnicowania kopii mRNA; R=2-66CT – znormalizowana wartość względnego poziomu ekspresji badanego genu względem GAPDH wyliczona w programie REST; ?– obniżenie ekspresji; B– wzrost ekspresji.    histopatologicznego (X) G1. G2. G3. R=2- 66CT. p-value. MTNR1A. 1,5. 0,89. . MTNR1B. 467. 0,11. . MTNR1A. 25. 0,37. . MTNR1B. 65. 0,38. . MTNR1A. 0,039. 0,79. . MTNR1B. 1,36. 0,96. . 8    3 ) 3

(829)  #>'-

(830)  %%

(831)  % 3D-DF

(832) $

(833) % 3D; 

(834)  "  3 )3)

(835) %3 3

(836)   $

(837) 3 $$'> 3

(838)  #>'-  %%

(839)  ("   

(840)   . 

(841) $6#

(842) 

(843) U]7/8 

(844) 

(845) R $

(846) $*['#B !'3% %  3$$

(847)  %/. Dyskusja 

(848) 

(849) 

(850) " $    

(851)  $  

(852) 

(853) $ $

(854) 

(855)  %)$%%(%3%

(856)   *

(857) :N/  %  +-=./ V   3$ % %

(858)   $( % $

(859)  

(860)   %$

(861)  

(862) 35

(863) ) %3% $

(864)  % $(

(865)  %%%/ U . %* $  *  *$

(866) 3     

(867) % *3$ %  

(868) 

(869) 3

(870) 

(871) 

(872) 

(873)

(874) 3 3 

(875)  3%   

(876) 

(877) %

(878)  3   

(879) 

(880)    >

(881) 

(882)  !

(883) U %&+-C./E

(884) $)* 

(885) 

(886) $ 3% (%%3 3

(887)   $( 

(888)

(889) 3 !9 : $( 

(890)

(891)  "E#FK  $(  

(892)

(893)  C$  $( %*E4B-C $( 

(894)  $P>!

(895)  $( 

(896)

(897) 3 

(898) V>!

(899) B+-:./8

(900)  

(901) $

(902) %3%$

(903) 

(904)  %() (% %

(905) )  

(906)  

(907) ) 

(908)  

(909) /$%3 

(910)  $"

(911) %% %

(912) 03 

(913) %

(914) . )*

(915) " "$

(916) %("3

(917)  %%(% 3/ 

(918)  

(919)    $

(920)      %+-G./ B%  %

(921) "

(922) 

(923) % 3

(924) % 

(925) $

(926) %3

(927)   

(928)

(929) $$3)*

(930) 3 * 

(931) KN/ 

(932)  

(933)    % 3/ +-K./ 

(934) 

(935)   %

(936)

(937)  

(938)  %*    " 3 $ $

(939)  %     $3

(940) 

(941) $ 

(942)  

(943)      % 3%

(944)     $$ 3

(945)  3 )  $%) 6   ")  ) $

(946) 7/ 8 3

(947)  3  %

(948) %

(949)   $

(950) / 83 3

(951)   

(952) 

(953)

(954) $$%

(955) .  " 3 $$

(956) % %%3(%

(957)  3 )/' %() 

(958) 

(959)

(960) $$ %*.

(961) ) %")$   3 )*

(962)  

(963) 

(964)  (%/. Nr 4/2015. Poziom     X vs K. Gen. H

(965) $

(966) 

Cytaty

Powiązane dokumenty

Quantitative analysis of mRNA TGFb1 and expression of its receptors (copies/µg RNA) in thyroid tissue of patients with papillary cancer (PTC), non­toxic (NG) and toxic nodular

Ekspresja analizowanych genów w zdrowych i nowotworowych próbkach tarczycy różni się znamiennie (test Kruskala-Wallisa, p &lt; 0,002); PTC (papillary thyroid carcinoma) —

Porównanie ekspresji genu KCNJ2 w raku brodawkowatym tarczycy i zdrowym gruczole przy użyciu testu Kruskala-Wallisa.. Różnica w ekspresji jest znamienna statystycznie (p &lt;

The aim of this study was to assess the effect of adalimumab on changes in the gene expression profile associated with drug resistance in Normal Human Der- mal Fibroblasts

Subsequent studies did not confirm the association between CK-MM gene polymorphism and muscle performance [34,48]; however, they revealed a relationship between the NcoI A/A

signaling pathways associated with interleukins 12 and 23 and epigenetic mechanism of sequential-specific regulation of expression of related genes by mirnAs as molecular markers

Regarding Notch 2 gene, the current study showed increased expression of Notch 2 gene in patients with T2DM compared to normal subjects and there was a significant positive

W wyniku badañ przeciwnowotwo- rowych genów supresorowych pro- wadzonych za pomoc¹ technik cy- togenetycznych i molekularnych wy- kazano, ¿e wbrew wczeœniejszym pogl¹dom funkcja