Startery do identyfikacji i amplifikacji sekwencji intronów jhbp

Nazwa Sekwencja Opis

JR 16 ^{AGT CTC AGT ATA TTG CCG TCA} ATC AC

Zaprojektowany na podstawie sekwencji cDNA JHBP z G. mellonella. Przedni, poáo*enie 12-35, T_m= 54,8˚C. Zaprojektowany przez dr. in*. J. Rodrigueza.

WRA 296 ^{CAC AAG GCT CTG TCG ATA AGT} TGA G

Zaprojektowany na podstawie sekwencji cDNA JHBP z G. mellonella (amplifikacja intronu A). Wsteczny, poáo*enie 4597-4573, Tm= 63˚C.

KC 1 ^{TGT ACT AAT CAG TTT TCA CTT} TTA GGA G

Zaprojektowany na podstawie sekwencji intronu A z G. mellonella amplifikowanego za pomoc starterów JR 16 i WRA 296. Przedni, poáo*enie 342-369, Tm= 51,5˚C. Zaprojektowany przez mgr in*. Kamil Czajewsk.

KC 2 ^{CCG AGG TTT TTC CAA GAG ACT} ATT ACA

Zaprojektowany na podstawie sekwencji intronu A z G. mellonella amplifikowanego za pomoc starterów JR 16 i WRA 296. Wsteczny, poáo*enie 4286-4260, T_m= 57,3˚C. Zaprojektowany przez mgr in*. Kamil Czajewsk.

Nazwa Sekwencja Opis

AS 18 ^{ATA CTT ATC ATC ATC ATT ATA} TCA GCC

Zaprojektowany na podstawie sekwencji intronu A z G. mellonella amplifikowanego za pomoc starterów KC 1 i KC 2. Wsteczny, poáo*enie 3754-3728, T_m= 49,6˚C.

AS 17 ^{AGT ATA AAT CCA ACT CGG CTG} GGC AG

Zaprojektowany na podstawie sekwencji intronu A z G. mellonella amplifikowanego za pomoc starterów KC 1 i KC 2. Przedni, poáo*enie 1134-1159, Tm= 63,4˚C.

AS 19 ^{ATG CGG GGT TGC CCC TAG AAA} ATG AG

Zaprojektowany na podstawie sekwencji intronu A z G. mellonella amplifikowanego za pomoc starterów KC 1 i KC 2. Wsteczny, poáo*enie 3268-3242, Tm= 66,3˚C.

KC 12 ^{GGC TAT GGA GAG AAC TAT GCT} TG

Zaprojektowany na podstawie sekwencji intronu A z G. mellonella amplifikowanego za pomoc starterów AS 17 i AS 19. Przedni, poáo*enie 1316-1338, T_m= 51,9˚C. Zaprojektowany przez mgr in*. Kamil Czajewsk.

KC 13 ^{TAA TTA CTT TGT ACG CTG ACT} GAC CTC

Zaprojektowany na podstawie sekwencji intronu A z G. mellonella amplifikowanego za pomoc starterów AS 17 i AS 19. Wsteczny, poáo*enie 2764-2738, Tm= 54,5˚C. Zaprojektowany przez mgr in*. Kamil Czajewsk.

WRA 293 ^{CTC AAC TTA TCG ACA GAG CCT} TGT G

Zaprojektowany na podstawie sekwencji cDNA JHBP z G. mellonella (amplifikacja intronu B). Przedni, poáo*enie 4573-4597, T_m= 63˚C.

AS 5 ^{GTA GGT TTT TGA TGA CTT AGG} CAA TTC

Zaprojektowany na podstawie sekwencji cDNA JHBP z G. mellonella (amplifikacja intronu B). Wsteczny, poáo*enie 7221-7195, Tm= 55,1˚C.

KC 3 ^{CGG TAC AAT AAT TTA AAG GTA} ACC GGA

Zaprojektowany na podstawie sekwencji intronu B z G. mellonella amplifikowanego za pomoc starterów WRA 293 i AS 5. Przedni, poáo*enie 4747-4773, Tm= 57,1˚C. Zaprojektowany przez mgr in*. Kamil Czajewsk.

KC 4 ^{GTG ACC CCA AAC AAT CAA AAA} CTA GGC

Zaprojektowany na podstawie sekwencji intronu B z G. mellonella amplifikowanego za pomoc starterów WRA 293 i AS 5. Wsteczny, poáo*enie 7033-7007, T_m= 60,9˚C. Zaprojektowany przez mgr in*. Kamil Czajewsk.

AS 20 ^{GTC TAA CGA TAT CTA CAT TAT} CTG TC

Zaprojektowany na podstawie sekwencji intronu B z G. mellonella amplifikowanego za pomoc starterów KC 3 i KC 4. Przedni, poáo*enie 5102-5128, Tm= 45,7˚C.

AS 22 ^{AAA GTG TAC AAT AAC AGA ATT} CTT TCC

Zaprojektowany na podstawie sekwencji intronu B z G. mellonella amplifikowanego za pomoc starterów KC 3 i KC 4. Wsteczny, poáo*enie 6804-6778, Tm= 51,1˚C.

AS 21 ^{GCC ACC TCC TAT TAG GTG GAT} TTA TC

Zaprojektowany na podstawie sekwencji intronu B z G. mellonella amplifikowanego za pomoc starterów KC 3 i KC 4. Przedni, poáo*enie 5586-5611, T_m= 56,6˚C.

AS 23 ^{CTA AAC AGC GGA CTG ACT TTT} TAA TGC

Zaprojektowany na podstawie sekwencji intronu B z G. mellonella. Przedni, poáo*enie 6413-6439, Tm= 57,9˚C.

Nazwa Sekwencja Opis

KC 9 ^{CTA TTT TCA GTA TTA TTT TTG} GCT G

Zaprojektowany na podstawie sekwencji cDNA JHBP z G. mellonella. Przedni, poáo*enie 7033-7057, T_m= 49,2˚C. Zaprojektowany przez mgr in*. Kamil Czajewsk.

AS 16 ^{TCA TCA AAA ACC TAC ACA GGA} GAA GTC

Zaprojektowany na podstawie sekwencji cDNA JHBP z G. mellonella (amplifikacja intronu C). Przedni, poáo*enie 7207-7233, Tm= 56,1˚C. AS 8 ^{CTT CAC GCT ATA ACT ATA AGC}

AGC TCC

Zaprojektowany na podstawie sekwencji cDNA JHBP z G. mellonella (amplifikacja intronu C). Wsteczny, poáo*enie 8379-8353, T_m= 55,7˚C.

KC 5 ^{GCC TCA TTG TTT TAT ACC AAT} ACG

Zaprojektowany na podstawie sekwencji intronu C z G. mellonella amplifikowanego za pomoc starterów AS 16 i AS 8. Przedni, poáo*enie 7619-7642, T_m= 51,9˚C. Zaprojektowany przez mgr in*. Kamil Czajewsk.

KC 6 ^{ATC ACG ATG GGC TAA CTG ACC} TG

Zaprojektowany na podstawie sekwencji intronu C z G. mellonella amplifikowanego za pomoc starterów AS 16 i AS 8. Wsteczny, poáo*enie 8094-8072, Tm= 52,6˚C˚C Zaprojektowany przez mgr in*. Kamil Czajewsk.

KC 10 ^{ATA GAG TAA GTT ATA TCT GTC} AAG

Zaprojektowany na podstawie sekwencji intronu C z G. mellonella Przedni, poáo*enie 7281-7304, T_m= 39,3˚C Zaprojektowany przez mgr in*. Kamil Czajewsk.

KC 11 ^{AAA TAT TGC ATA TCT GTA ATT} ACA GG

Poáo*enie 8317-8342, Tm= 48,6˚C Zaprojektowany przez mgr in*. Kamil Czajewsk.

JR 18 ^{GTT ATA GCG TGA AGA CTG ATG} ATG ATA AAG

Zaprojektowany na podstawie sekwencji cDNA JHBP z G. mellonella. Przedni, poáo*enie 8366-8392, Tm= 52,3˚C. Zaprojektowany przez dr in*. J. Rodrigueza.

AS 10 ^{CCT CCG TTA GTT GTT TAC CAT} ATC CCG

Zaprojektowany na podstawie sekwencji cDNA JHBP z G. mellonella (amplifikacji intronu D). Wsteczny, poáo*enie 9402-9376, T_m= 60,8˚C.

JR 21 ^{CCG AAG CTT TTA AAC ATT TTT} GAA GTA TGC ACT C

Zaprojektowany na podstawie sekwencji cDNA JHBP z G. mellonella. Wsteczny, poáo*enie 9515-9490, Tm= 64,4˚C. Zaprojektowany przez dr in*. J. Rodrigueza.

KC 7 ^{CAT ATG TGA ACC ACG TGA ACG} T

Zaprojektowany na podstawie sekwencji intronu D z G. mellonella amplifikowanego za pomoc starterów JR 18 i AS 10. Przedni, poáo*enie 8750-8771, Tm=52,4˚C.Zaprojektowany przez mgr in*. Kamil Czajewsk.

KC 8 ^{GTC AGT CAG TCA GTT TGT TTG} TC

Zaprojektowany na podstawie sekwencji intronu D z G. mellonella amplifikowanego za pomoc starterów JR 18 i AS 10. Wsteczny, poáo*enie 9093-9071, T_m= 48˚C. Zaprojektowany przez mgr in*. Kamil Czajewsk.

JR 13 ^{CCG GAA TTC TAG AAT GCA TAA} GCA AAG

Zaprojektowany na podstawie sekwencji cDNA JHBP z G. mellonella. Przedni, poáo*enie 4610-4627, Tm= 48˚C. Zaprojektowany przez dr in*. J. Rodrigueza

Nazwa Sekwencja Opis

JR 19 ^{CCA AAT ATT TCG CAA GAA ACC} GTT TCT G

Zaprojektowany na podstawie sekwencji cDNA JHBP z G. mellonella. Wsteczny, poáo*enie 8417-8444, T_m= 56˚C. Zaprojektowany przez dr in*. J. Rodrigueza

JR 20 ^{CCG GAA TTC AGT AAA CTC AAC} TTA TCG ACA GA

Zaprojektowany na podstawie sekwencji cDNA JHBP z G. mellonella. Przedni, poáo*enie 4567-4589, Tm= 62˚C. Zaprojektowany przez dr in*. J. Rodrigueza