Zadanie 6 Jmol
1. Pobierz z Protein Data Bank model „5F9R” (kompleks białka z RNA i DNA – narzędzie CRISPR/Cas9 do cięcia łańcuchów DNA).
2. Zmień schemat wyświetlania na „cartoon” (rysunek) aby uwidocznić drugorzędowe struktury białka, DNA i RNA (α-helisy, arkusze (harmonijki) beta, beta zakręty).
3. Wyświetl tylko DNA.
4. Wyświetl DNA oraz RNA.
5. Wyświetl fragment łańcucha DNA oraz fragment łańcucha RNA które są połączone ze sobą. (tzn.: deoksynukleotydy od 11 do 30 w łańcuchu C, oraz nukleotydy od 1 do 20 w łańcuchu A)
6. Zmień schemat wyświetlania na „wireframe” (obraz szkieletowy).
7. Grubość szkieletu („wireframe”) 30.
8. Zaznacz wyświetlony fragment łańcucha DNA i RNA.
9. Pokaż wiązania wodorowe między łańcuchami DNA i RNA.
10. Zmień grubość wiązań wodorowych na „50”.
11. Zaznacz deoksynukleotydy z deoksyguanozyną („DG”) w widocznym fragm. DNA („11-30:C”).
12. Zmień ich kolor na błękitny („skyblue”).
13. Zaznacz nukleotydy z cytydyną („C”) w widocznym fragm. RNA („1-20:A”).
14. Zmień ich kolor na chabrowy („cornflowerblue”).
15. Zaznacz deoksynukleotydy z deoksycytydyną („DC”) w widocznym fragm. DNA.
16. Zmień ich kolor na zielony („green”).
17. Zaznacz nukleotydy z guanozyną („G”) w widocznym fragm. RNA.
18. Zmień ich kolor na wiosenną zieleń („springgreen”).
19. Zaznacz deoksynukleotydy z deoksyadenozyną („DA”) w widocznym fragm. DNA.
20. Zmień ich kolor na głęboki róż („deeppink”).
21. Zaznacz nukleotydy z urydyną („U”) w widocznym fragm. RNA.
22. Zmień ich kolor na czerwony („red”).
23. Zaznacz deoksynukleotydy z tymidyną („DT”) w widocznym fragm. DNA.
24. Zmień ich kolor na niebiesko- fioletowy („blueviolet”).
25. Zaznacz nukleotydy z adenozyną („A”) w widocznym fragm. RNA.
26. Zmień ich kolor na fioletowy („violet”).
27. .Zmień kolor tła na biały.
28. Zapisz otrzymany model jako plik
*.jpg i wyślij na mój adres w dzienniku.
