STOPNIE I TYTUŁY NAUKOWE UZYSKANE PRZEZ PRACOWNIKÓW KATEDRY stopień doktora habilitowanego:
V. KATEDRA MIKROBIOLOGII
Kierownik: prof. dr hab. Józef Kur, prof. zw. PG dr Beata Krawczyk, ad.
dr Elżbieta Hiszczyńska-Sawicka, ad. (do 30.10.2008) dr inż. Paweł Sachadyn, ad.
dr inż. Radosław Pladzyk, ad. (do 30.09.2008) dr inż. Hubert Cieśliński, ad.
dr inż. Rafał Piątek, ad.
dr Beata Zalewska-Piątek, ad.
dr inż. Marta Wanarska, ad.
dr inż. Anna Brillowska-Dąbrowska, ad.
dr inż. Marcin Olszewski, ad.
dr inż. Lucyna Holec-Gąsior, ad. (od 15.07.2008) Iwona Henke, st. tech.
Anna Wójcikowska, st. ref.
Doktoranci:
mgr inż. Katarzyna Bury mgr inż. Anna Długołęcka mgr inż. Marta Kur
mgr inż. Justyna Leibner-Ciszak mgr inż. Małgorzata Mickiewicz mgr inż. Katarzyna Werbowy mgr inż. Piotr Hildebrandt mgr inż. Karolina Stojowska mgr inż. Anna Mielech mgr inż. Sabina Wilkanowicz mgr inż. Ewa Kabat
Tematyka prowadzonych badań naukowych
Obecna działalność naukowo-badawcza związana jest głównie z biologią molekularną, biotechnologią medyczną i przemysłową, i wykorzystuje techniki rekombinacji DNA in vitro.
Realizowane badania obejmują trzy tematy:
- diagnostykę molekularną,
- molekularne mechanizmy patogenności mikroorganizmów,
- białka organizmów ekstremofilnych - produkcja, charakterystyka molekularna i zastoso-wanie.
W ramach tematu dotyczącego diagnostyki molekularnej realizowane są projekty konstruowania i testowania nowych systemów diagnostycznych opartych o różne techniki biologii molekularnej, w tym o technikę PCR, do identyfikacji czynników infekcyjnych takich jak wirusy, bakterie, grzyby oraz do typowania genetycznego i różnicowania szczepów mikroorganizmów w różnych aspektach badań epidemiologicznych. Ponadto, tematyka ta obejmuje konstruowanie nowych testów immunodiagnostycznych do rozpoznawania toksoplazmozy w oparciu o własne biotechnologiczne systemy nadprodukcji i oczyszczania antygenów rekombinantowych Toxoplasma gondii.
Badania molekularnych mechanizmów patogenności mikroorganizmów dotyczą operonu dra uropatogennych szczepów Escherichia coli oraz wykorzystania zdobytej wiedzy w tym zakresie do projektowania, syntezy i badania nowej klasy związków przeciwbakteryjnych hamu-jących proces biogenezy fimbrii, będących czynnikami wirulencji.
Badania białek organizmów ekstremofilnych dotyczą konstruowania biotechnologicz-nych systemów ekspresyjnych, opracowywania wydajnych procedur oczyszczania oraz charakterystyki molekularnej białek takich jak: termostabilne i zaadaptowane do zimna β-galaktozydazy, lipazy, ptoteazy oraz białka wiążące jednoniciowe DNA mikroorganizmów ekstremofilnych.
ARTYKUŁY W CZASOPISMACH Z LISTY FILADELFIJSKIEJ
1. A nosocomial outbreak of Candida parapsilosis in southern Sweden verified by genotyping / Brillowska-Dąbrowska A., Schon T., Pannanusorn S., Lonnbro N., Bernhoff L., Bonnedal J., Haggstrom J., Wistedt A., Fernandez T., Arendrup M. // Scandinavian J. Infectious Diseases.
- Vol. 20 (2008), s. 1-7 AF 79939
82
2. ALIS-FLP: amplified ligation selected fragment-length polymorphism method for microbial genotyping / Brillowska-Dąbrowska A., Wianecka M., Dąbrowski S., Mladenovska Z., Kur J., Ahring B. // Scandinavian J. Clinical and Laboratory Investigation. - Vol. 68 (2008), s.
720-730 AF 79940
3. Amplification of a single-locus variable-number direct-repeats with restriction fragment length polymorphism (DR-PCR/RFLP) for genetic typing of Acinetobacter baumannii strains / Nowak-Zaleska A., Krawczyk B., Kotłowski R., Mikucka A., Gospodarek E. // Polish J.
Microbiology. - Vol. 57, nr 1 (2008), s. 11-17 AF 79905 4. Experimental guinea pig model of dermatophytosis: a simple and useful tool for the
evaluation of new diagnostics and antifungals / Saunte D.M., Hasselby J.P., Brillowska-Dąbrowska A., Frimodt-Møller N., Svejgaard E.L., Linnemann d ., Nielsen S.S., Hædersdal M., Arendrup M.C. // Medical Mycology. - Vol. 46, nr 4 (2008), s. 303-313 AF 79473 5. Extracellular secretion of Pseudoalteromonas sp. cold-adapted esterase in Escherichia coli in the presence of Pseudoalteromonas sp. components of ABC transport system / Długołęcka A., Cieśliński H., Turkiewicz M., Białkowska A., Kur J. // Protein Expression and Purification. - Vol. 62, iss. 2 (2008), s. 179-184 AF 80038 6. Molecular characterization of a cryptic plasmid from the psychrotrophic antarctic bacterium Pseudoalteromonas sp. 643A / Cieśliński H., Werbowy K., Kur J., Turkiewicz M. // Plasmid.
- Vol. 60, iss. 2 (2008), s. 154-158 AF 80039
7. Naturally occurring mitochondrial DNA heteroplasmy in the MRL mouse / Sachadyn P., Zhang X., Clark L.D., Naviaux R.K., Heber-Katz E. // Mitochondrion. - Vol. 8, iss. 5-6
(2008), s. 358-366 AF 80037
8. Olszewski M., Mickiewicz M., Kur J.: Two highly thermostable paralogous single-stranded DNA-binding proteins from Thermoanaerobacter tengcongensis // Archives Microbiology. -
Vol. 190, nr 1 (2008), s. 79-87 AF 80036
9. Toxoplasma gondii: chimeric Dr fimbriae as a recombinant vaccine against toxoplasmosis / Gatkowska J., Gąsior A., Kur J., Długońska H. // Experimental Parasitology. - Vol. 118, nr 2
(2008), s. 266-270 AF 77542
10. Toxoplasma gondii: enzyme-linked immunosorbent assay using different fragments of recombinant microneme protein 1 (MIC1) for detection of immunoglobulin G antibodies / Holec-Gąsior L., Gąsior A., Brillowska-Dąbrowska A., Kur J. // Experimental Parasitology. -
Vol. 119, iss. 1 (2008), s. 1-6 AF 80944
- Type II secretory pathway for surface secretion of DraD invasin from the uropathogenic Escherichia coli Dr+ strain / Zalewska-Piątek B., Bury K., Piątek R., Bruździak P., Kur J. //
J. Bacteriology. - Vol. 190, nr 14 (2008), s. 5044-5056 /por. poz. II.11/ AF 80041
ARTYKUŁY W INNYCH CZASOPISMACH RECENZOWANYCH
1. Krawczyk B., Stojowska K., Leibner-Ciszak J.: Opracowanie zestawu diagnostycznego do genetycznego typowania szczepów bakteryjnych metodą PCR MP // Medycyna Doświad-czalna i Mikrobiologia. - Vol. 60, nr 2 (2008), s. 139-154 AR 79486 2. Krawczyk B., Stojowska K.: Metody molekularne w dochodzeniach epidemiologicznych
zakażeń szpitalnych // Badanie i Diagnoza. - Vol. 14, nr 8/9 (2008), s. 53-58 AR 80321 3. Krawczyk B., Stojowska K.: Wykorzystanie reakcji PCR do badania charakterystycznych obszarów genomu // Badanie i Diagnoza. - Vol. 14, nr 8/9 (2008), s. 59-64 AR 80329 4. Wanarska M., Hildebrandt P., Kur J.: Drożdżowe systemy ekspresyjne jako narzędzie
nowo-czesnej mikrobiologii przemysłowej // Postępy Mikrobiologii = Advances in Microbiology. -
T. 47, z. 3 (2008), s. 249-256 AR 80040
5. Występowanie specyficznych przeciwciał anty-Toxoplasma gondii w grupie pracowników leśnych z województwa pomorskiego i warmińsko-mazurskiego / Holec-Gąsior L., Stańczak
J., Myjak P., Kur J. // Wiadomości Parazytologiczne. - Vol. 54, nr 3 (2008), s. 231-236 AR 79877 6. Zalewska-Piątek B., Piątek R., Kur J.: Czynniki adhezyjne i inwazyjne uropatogennych
szczepów Escherichia coli - problematyka infekcji dróg moczowych oraz mechanizmów patogenności // Postępy Mikrobiologii = Advances in Microbiology. - T. 47, z. 3 (2008), s.
199-206 AR 80022
MONOGRAFIE I PODRĘCZNIKI AKADEMICKIE
1. Krawczyk B., Kur J.: Diagnostyka molekularna w mikrobiologii. - Gdańsk : Wydaw.
Politechniki Gdańskiej, 2008. - 171 s. PA 80969
PATENTY, ZGŁOSZENIA PATENTOWE, WZORY UŻYTKOWE
1. Gen mod-rsfp, jego sekwencja, jej otrzymywanie i jego zastosowanie jako gen markerowy / Cieśliński H., Długołęcka ., Kur J., Turkiewicz M. Zgłoszenie patentowe P 386941 z dnia
29.12.2008. 36 s. X 82416
2. Hildebrandt P., Wanarska M., Kur J.: Zaadaptowana do zimna B-D-galaktozydaza Arthrobacter sp. 32c, sposób jej otrzymywania oraz sekwencje i szczepy wykorzystywane w tym sposobie. Zgłoszenie patentowe P 386344 z dnia 24.10.2008 X 81031 3. Sachadyn P., Stanisławska-Sachadyn A., Kur J.: Fuzyjne białko zawierające domeny MutS i
β-galaktozydazę, wektor plazmidowy, sposób otrzymywania fuzyjnego białka oraz sposób jego zastosowania do wykrywania mutacji i niekomplementarności w DNA. Zgłoszenie
patentowe nr P 384644 z dnia 3.10.2008 X 81955
PROJEKTY BADAWCZE MNiSW Projekty zakończone
promotorskie
"Zimnolubna estero/lipaza Pseudoalteromonas sp. 643A-oczyszczanie i charakterystyka wybranych właściwości enzymu"
Kierownik i główni wykonawcy badań: J. Kur, A. Długołęcka (Grant nr N302 039 31/3427, umowa nr 3427/P01/2006/31)
habilitacyjne
„Zastosowanie nowej techniki PCR-MP w badaniach epidemiologicznych”
Kierownik i główny wykonawca badań: B. Krawczyk (Grant N404 078 31/3454, umowa nr 3454/P01/2006/31)
Projekty realizowane własne
„Białko DraD jako powierzchniowo eksprymowany czynnik inwazyjny uropatogennych szczepów Escherichia coli Dr+ - identyfikacja systemu sekrecji oraz determinacja minimal-nego fragmentu białka niezbędminimal-nego w procesie inwazji’’
Kierownik i główni wykonawcy badań: B. Zalewska-Piątek, J. Kur, K. Bury, R. Piątek, M.
Kur
(Grant nr N401 156 32/3040, umowa nr 3040/P01/2007/32)
„Białka RecA mikroorganizmów z rodzaju Thermus i Deinococcus - produkcja w systemach ekspresji Escherichia coli, charakterystyka biochemiczna oraz badanie możliwości
zastoso-84
wania w technikach biologii molekularnej”
Kierownik i główni wykonawcy badań: J. Kur, B. Krawczyk, M. Wanarska (Grant N302 067934, umowa nr 0679/B/P01/2008/34)
„Pilicydy jako nowa grupa chemoterapeutyków skierowanych przeciwko uropatogennym szczepom Escherichia coli – projektowanie, synteza oraz badanie spektrum aktywności”
Kierownik i główni wykonawcy badań: R. Piątek, K. Dzierzbicka, S. Makowiec, B.
Zalewska-Piątek, M. Wojciechowski
(Grant N401 221834, umowa nr 2218/B/P01/2008/34)
"Opracowanie zestawu do wykrywania oraz identyfikacji zakażeń układowych Candida sp."
Kierownik i główny wykonawca badań: A. Brillowska-Dąbrowska (Grant N401 221934, umowa nr 2219/B/P01/2008/34)
promotorskie
„Identyfikacja reszt aminokwasowych kanałotwórczego białka DraC oddziaływujących z kompleksem białko opiekuńcze drab/adhezyjna DraE – wyznaczenie celu molekularnego dla potencjalnych leków przeciw uropatogennym szczepom Escherichia coli”
Kierownik i główni wykonawcy badań: J. Kur, M. Kur (Grant N301 116 31/3511, umowa nr 3511/PO1/2006/31)
„Technika PCR MP w typowaniu genetycznym drożdżaków w rodzaju Candida – optyma-lizacja, walidacja i konstrukcja zestawu diagnostycznego”
Kierownik i główni wykonawcy badań: J. Kur, J. Leibner-Ciszak (Grant N401 0728 33/0728, umowa nr 0728/B/P01/2007/33)
„Konstrukcja rekombinantowego szczepu drożdży Saccharomyces cerevisiae produkującego zewnątrzkomórkowo zaadoptowaną do zimna beta-D-galaktazydazę, zdolnego do wydajnej produkcji etanolu z laktozy zawartej w serwatce”
Kierownik i główni wykonawcy badań: J. Kur, P. Hildebrandt (Grant N302 138835, umowa nr 1388/B/P01/2008/35)
„Konstrukcja wektorów wahadłowych i ekspresyjnych dla psychrofilnych i psychrotrofo-wych bakterii oraz przykłady zastosowań tych wektorów do produkcji zaadaptowanych do zimna enzymów”
Kierownik i główni wykonawcy badań: J. Kur, K. Werbowy (Grant N302 118635, umowa nr 1186/B/P01/2008/35)
„Aparatura i sprzęt w Laboratorium Diagnostyki Molekularnej w Katedrze Mikrobiologii i Katedrze Chemii, Technologii i Biotechnologii Żywności”
Kierownik i główny wykonawca badań: R. Katulski (Grant IA-355/2008 aparaturowy, umowa nr 5750/IA/155/2008)
PRACE BADAWCZO-ROZWOJOWE ZLECONE PRZEZ PODMIOTY LUB INSTYTUCJE KRAJOWE I ZAGRANICZNE (INNE NIŻ PROJEKTY EUROPEJSKIE, MNiSW)
„Konstrukcja serologicznych zestawów diagnostycznych do wykrywania oraz różnicowania toksoplazmozy wczesnej i przewlekłej”
Kierownik i główni wykonawcy badań: J. Kur, L. Holec, E. Hiszczyńska-Sawicka, H. Dłu-gońska, P. Myjak, A. Gąsior, J. Gatkowska
(Fundacja na Rzecz Wspierania Rozwoju Polskiej Farmacji i Medycyny, umowa nr 15/V/2006)
PROMOTORSTWO DOKTORANTÓW - Kur, J., prof. dr hab. (promotor) 1. Długołęcka A., Wydział Chemiczny PG 2. Bury K., Wydział Chemiczny PG
RECENZJE PRAC DOKTORSKICH - Kur J., prof. dr hab. (rec.)
1. Chęć E.: Zastosowanie bakterii Vibrio harveyi do wykrywania mutagennych zanieczyszczeń wody morskiej, Morski Instytut Oceanologii PAN
2. Adamiak B.: Structural and functional analysis of herpes simplex virus envelope glycoproteins gC and mgG2, Międzyuczelniany Wydział Biotechnologii AMG I UG
3. Żaczek A.: Molekularna charakterystyka szczepów Mycobacterium tuberculosis, opornych na podstawo-we tuberkulostatyki, Wydział Mikrobiologii i Ochrony Środowiska, Unipodstawo-wersytet Łódzki
RECENZJE PRAC HABILITACYJNYCH - Kur J., prof. dr hab. (rec.)
1. Kozłowski P.: Nowoczesne metody wykrywania mutacji w genach – usprawnienia i nowe zastosowania, Instytut Chemii Bioorganicznej PAN w Poznaniu
OPINIE
- Kur J., prof. dr hab. (opinia)
1. dr hab. A. Skłodowska, opinia w związku z postępowaniem o nadanie tytułu profesora dla Centralnej Komisji ds. Tytułu Naukowego i Stopni Naukowych.
2. prof. Erick Vandamme, opinia w sprawie nadania profesorowi tytułu doktora honoris causa Politechniki Łódzkiej
3. Opinia o działalności statutowej Morskiego Instytutu Oceanologii PAN w Sopocie - raport etapowy tematu nr IV.3 działalności statutowej za rok 2008 pt. Badanie molekularnego podłoża podstawowych procesów biologicznych (replikacji, regulacji metabolizmu i ewolucji) u organizmów morskich oraz ich potencjalnego znaczenia biotechnologicznego
4. Opinia wniosku Wydziału Biotechnologii i Nauk o Żywności Politechniki Łódzkiej o przyznanie uprawnień do nadawania stopnia doktora habilitowanego nauk technicznych w dyscyplinie biotechno-logia
5. Ocena wartości naukowej prac zgłoszonych przez Instytut Biochemii i Biofizyki do zespołowych nagród naukowych, dla Wydziału II Polskiej Akademii Nauk
CZŁONKOSTWO Z WYBORU W ORGANIZACJACH NAUKOWYCH I KOMITETACH REDAKCYJNYCH CZASOPISM NAUKOWYCH
1. Kur J., prof. dr hab.
- członek Komitetu Mikrobiologii PAN - członek Komitetu Biotechnologii PAN
- członek Interdyscyplinarnego Zespołu do Spraw Rozwoju Biogospodarki w MNiSW - przewodniczący Oddziału Gdańskiego Polskiego Towarzystwa Mikrobiologów - edytor i członek Zespołu Redakcyjnego czasopisma Environmental Biotechnology - członek Zespołu Redakcyjnego czasopisma Acta Biochimica Polonica
- członek Zespołu Redakcyjnego czasopisma Postępy Mikrobiologii - członek Zespołu Redakcyjnego Advances in Agricultural Sciences
WYMIANA MIĘDZYNARODOWA
1. Hiszczyńska-Sawicka E. – University of Lincoln. Christchurch, New Zealand, ( od 01.03.2005 do31.01.2008
2. Sachadyn P. - Institut Wistara, Philadelphia, USA, od 15.09.2005 do 30.06.2008
86