• Nie Znaleziono Wyników

Medycyna Weterynaryjna - Summary Medycyna Wet. 62 (11), 1229-1232, 2006

N/A
N/A
Protected

Academic year: 2021

Share "Medycyna Weterynaryjna - Summary Medycyna Wet. 62 (11), 1229-1232, 2006"

Copied!
4
0
0

Pełen tekst

(1)

Medycyna Wet. 2006, 62 (11) 1229

Artyku³ przegl¹dowy Review

Ocena wartoœci hodowlanej zwierzêcia na podsta-wie fenotypu jest ma³o precyzyjna, dlatego coraz czêœ-ciej wykorzystuje siê do tego metody biologii mole-kularnej. Naturalnie wystêpuj¹ca zmiennoœæ nukleoty-dów w DNA, bêd¹ca wynikiem zmian dokonuj¹cych siê w trakcie ewolucji, daje szansê na wykorzystanie jej w okreœlaniu stopnia pokrewieñstwa lub odmien-noœci u osobników, które czêsto posiadaj¹ podobne cechy na poziomie fenotypowym (8). Wykorzystanie markerów DNA stanowi dope³nienie tradycyjnych metod badawczych. Analizom poddawane s¹ zazwy-czaj odcinki genomu, charakteryzuj¹ce siê ró¿nym tem-pem ewolucji, co w konsekwencji przejawia siê od-miennym poziomem polimorfizmu (40). Coraz czêœ-ciej badacze zwracaj¹ uwagê na genom mitochondrial-ny (mtDNA), co zwi¹zane jest z jego specyficzmitochondrial-nym charakterem – wykazuje on mianowicie znacznie szyb-sze tempo mutacji ni¿ DNA j¹drowy (33). Dlatego te¿ na znaczeniu zyskuj¹ analizy molekularne genów w nim zlokalizowanych, miêdzy innymi genu cyto-chromu b, jak równie¿ wysoce polimorficzne sekwen-cje regionu kontrolnego (1).

Ogólna charakterystyka kompleksu bc1

i cytochromu b

Kompleks bc1 mitochondrialnego ³añcucha oddecho-wego (nazywany te¿ reduktaz¹ cytochromow¹ lub kompleksem III; EC 1.10.2.2) sk³ada siê z 11 podjed-nostek strukturalnych (bia³ko wielopodjednostkowe) osadzonych po wewnêtrznej stronie b³ony mitochon-drialnej. Podjednostki te obejmuj¹ bia³ka rdzeniowe I i II, cytochrom b (podjednostka III), cytochrom c1

(podjednostka IV), bia³ko Rieskiego (podjednostka V) i kilka mniejszych polipeptydów. Podjednostki III, IV, V s¹ g³ównymi bia³kami kompleksu, ich wzajemny stosunek wynosi 2 : 1 : 1 (27, 30). Oksydoreduktaza cytochromowa zaanga¿owana jest w transport elektro-nów wzd³u¿ b³ony lipidowej, z równoczesn¹ translo-kacj¹ protonów w poprzek membrany. Energia wytwo-rzonego gradientu protonów wykorzystywana jest na-stêpnie do wi¹zania energii chemicznej w postaci ATP z udzia³em ATPazy (11, 12). Po raz pierwszy kom-pleks bc1 wyizolowano z wewnêtrznej b³ony mitochon-drialnej serca wo³u (39), póŸniejsze badania krystalo-graficzne pozwoli³y na okreœlenie struktury komplek-su pochodz¹cego m.in. z mitochondriów drobiu i dro¿d¿y (15, 41).

U organizmów eukariotycznych kompleks

cytochro-mów bc1 jest dimerem. Ka¿dy monomer sk³ada siê

z trzech podjednostek katalitycznych, z nastêpuj¹cy-mi grupanastêpuj¹cy-mi prostetycznynastêpuj¹cy-mi: cytochrom b z 2 hemanastêpuj¹cy-mi typu b, cytochrom c1 z 1 hemem typu c oraz bia³ko Rieskiego zawieraj¹ce centrum reakcyjne 2Fe-2S.

Cy-tochrom c1 oraz bia³ko Rieskiego zakotwiczone s¹

w rdzeniu za pomoc¹ pojedynczych domen transb³o-nowych, ich domeny katalityczne zlokalizowane s¹ zaœ w przestrzeni miêdzyb³onowej (20, 29). Mitochondrial-ny cytochrom b jest integralMitochondrial-nym bia³kiem b³onowym

i stanowi rdzeñ kompleksu bc1 (24). Wystêpuje on

w postaci pojedynczego polipeptydu o masie oko³o 42,7 kDa (2) i zawiera od 378 (wó³) (39), 380 (ptaki) do 440 (bakterie fotosyntetyzuj¹ce) reszt aminokwa-sowych (31). Oba koñce tego bia³ka (–NH2 i –COOH) zlokalizowane s¹ w matriks mitochondrialnej (ryc. 1).

Mitochondrialny gen cytochromu b (MTCYB)

KAMILA KNAPIK, MAGDALENA JÊDRZEJCZAK, ANDRZEJ DYBUS

Zak³ad Cytogenetyki Molekularnej Wydzia³u Biotechnologii i Hodowli Zwierz¹t AR, ul. Doktora Judyma 12, 71-460 Szczecin

Knapik K., Jêdrzejczak M., Dybus A. Cytochrome b (MTCYB) mitochondrial genome

Summary

A broad analysis of organisms is possible using molecular DNA as a marker. Mitochondrial genome and genes present in mtDNA, e.g. cytochrome b gene, are widely used in investigations and the significance of this research is becoming increasing. This gene is coded by heavy (H) strand of mtDNA. Cytochrome b is one of 11 subunits composed of bc1 complex of respiratory chain of mitochondria, the sequence of which is written down in the mitochondrial genome. Cytochrome b gene traits are a slow rate of variations during evolution, the presence of some parts of the gene that are more conserved and those which show high divergence rates. Those traits make the cytochrome b gene useful as a marker in many analyses. The cytochrome b gene is used as a tool in such studies as: legal and veterinary medicine, palaeontology, as well as phylogenetics, and it can attain the status of a universal metric.

(2)

Medycyna Wet. 2006, 62 (11) 1230

Pocz¹tkowo przypuszczano, ¿e to wysoce konserwatywne bia³ko utwo-rzone jest przez dziewiêæ transb³ono-wych helis alfa (29, 35), jednak póŸ-niejsze analizy struktury pierwszorzê-dowej wykaza³y, ¿e zawiera ono 8 he-lis, które oznaczono od A do H (7). Helisy te po³¹czono w dwie grupy: A, B, C, D i E – pierwsza oraz F, G i H – druga. Oba hemy cytochromu b umiejscowione s¹ pomiêdzy helisami A, B, C i D. Budowa cz¹steczki cyto-chromu b jest stosunkowo prosta: 4 d³ugie pêtle (ab, cd, de i ef) i 3 krót-kie (bc, fg i gh) ³¹cz¹ helisy trans-membranowe. Pêtla de znajduje siê po stronie matriks, natomiast pozosta³e 3 d³ugie pêtle w przestrzeni miêdzy-b³onowej (39). Cytochrom b zawiera dwa hemy, bH i bL, ró¿ni¹ce siê po-tencja³em redoks i w³aœciwoœciami

spektralnymi. Hem bL (b-566), zlokalizowany blisko powierzchni b³ony cytoplazmatycznej ma mniejsze po-winowactwo do elektronów od hemu bH (b-562), znaj-duj¹cego siê bli¿ej matriks (10, 29). Wykazano, ¿e ligandami dla obu hemów b s¹ cztery wysoce konser-watywne histydyny, zlokalizowane w helisie B i D. Histydyny te s¹ najbardziej niezmiennymi sekwencja-mi cytochromu b (10, 35). Reduktaza cytochromowa jest drug¹ z trzech pomp protonowych ³añcucha odde-chowego. Jej funkcja polega na przenoszeniu elektro-nów z ubichinonu (koenzym Q) do cytochromu c, z równoczesnym pompowaniem protonów w poprzek wewnêtrznej b³ony mitochondrialnej. Dzia³anie kom-pleksu cytochromowego opisuje mechanizm zwany „cyklem Q” Mitchella (24) i „cyklem b” Wikstroma i wsp. (36). Koenzym Q, dzia³aj¹cy jako ruchomy ele-ment ³añcucha oddechowego, wystêpuje w du¿ym stê-¿eniu w wewnêtrznej b³onie mitochondrium, a niewiel-ka jego czêœæ zwi¹zana jest z kompleksem bc1. Trans-port jonów wodorowych w poprzek b³ony wymaga dwóch miejsc wi¹¿¹cych chinon, zlokalizowanych na przeciwleg³ych stronach b³ony. Podczas ca³ego cyklu utleniane s¹ dwie cz¹steczki ubichinolu, jedna cz¹s-teczka ubichinonu ulega redukcji, dwa elektrony prze-niesione s¹ na cytochrom c i cztery protony transloko-wane w poprzek b³ony lipidowej (28, 30).

Charakterystyka genu cytochromu b (MTCYB) Cytochrom b jest jedyn¹ podjednostk¹ kompleksu III, która kodowana jest przez mitochondrialny DNA (mtDNA). Gen cytochromu b (MTCYB) kodowany jest przez ³añcuch ciê¿ki (niæ H) mtDNA bogaty w gua-ninê i zlokalizowany w genomie mitochondrialnym cz³owieka pomiêdzy nukleotydami w pozycji 14 747 i 15 887 par zasad (2, 33), u ptaków zaœ po³o¿ony jest

pomiêdzy genami ND5 a tRNAThr. Gen MTCYB

cz³o-wieka obejmuje obszar o d³ugoœci 1140 nukleotydów

(bez intronów), koduj¹c pojedynczy polipeptyd. Na koñcu 5’ mRNA, tu¿ za kodonem „start” AUG, znaj-duje siê 4 nukleotydowy fragment niekoduj¹cy, zaœ na koñcu 3’ znajduje siê kodon „stop” UAA, a za nim uracyl (2, 33).

Mutacje mitochondrialnego genu cytochromu b U cz³owieka mitochondrialny DNA podlega muta-cjom oko³o 10 razy czêœciej ni¿ DNA j¹drowy, zwi¹-zane jest to z ma³o skutecznym systemem naprawy uszkodzeñ DNA, brakiem histonów oraz obecnoœci¹ du¿ej liczby wolnych rodników, wytwarzanych w pro-cesie fosforylacji oksydacyjnej. Poniewa¿ ka¿da komórka cia³a posiada setki mitochondriów i tysi¹ce cz¹steczek DNA, szkodliwe mutacje mtDNA mog¹ wyst¹piæ we wszystkich tkankach, zarówno somatycz-nych, jak i generatywnych. Te powstaj¹ce w mtDNA komórek linii p³ciowych mog¹ powodowaæ wystêpo-wanie nowego polimorfizmu DNA mitochondrialne-go lub choroby przekazywane potomstwu przez mat-kê. Mutacje pojawiaj¹ce siê w komórkach somatycz-nych mog¹ byæ zwi¹zane ze spadaj¹c¹ z wiekiem wy-dolnoœci¹ uk³adu fosforylacji oksydacyjnej (33). Zmia-ny w mtDNA s¹ odpowiedzialne za ró¿norodne cho-roby degeneracyjne, procesy starzenia siê czy te¿ no-wotwory. Patogenne mutacje mtDNA powodowane s¹ poprzez substytucje (mutacje punktowe) lub rearan-¿acje (delecje i duplikacje). Mutacje punktowe mog¹ dotyczyæ genów strukturalnych lub genów rRNA i tRNA. Zmiany w mtDNA mog¹ byæ tak¿e wywo³y-wane przez mutacje w genach j¹drowych, które kodu-j¹ bia³ka strukturalne mitochondriów lub bia³ka zwi¹-zane z regulacj¹ ich funkcji (34).

U ludzi opisano szereg dysfunkcji mitochondrial-nych powi¹zamitochondrial-nych z wystêpowaniem specyficzmitochondrial-nych mutacji w genie cytochromu b. Andreu i wsp. (3) opi-sali trzy mutacje nonsensowne (G15084A, G15168A Ryc. 1. Struktura bia³ka cytochromu b wg Esposti i wsp. (10), zmodyfikowa³ S. Zych N-koniec C-koniec matriks przestrzeñ miêdzyb³onowa ab bc cd de ef fg gh A B C D E F G H 30 54 104 79 114 134 205 179 228 249 309 287 320 242 372 352

(3)

Medycyna Wet. 2006, 62 (11) 1231

i G15723A), jedn¹ mutacjê zmiany sensu (G14846A) oraz delecjê 24 nukleotydów (od nukleotydu 15 498 do 15 521) w genie MTCYB u piêciu przebadanych pacjentów. Ka¿da z opisanych mutacji os³abia³a funk-cje enzymatyczne bia³ka cytochromu b. U pafunk-cjentów tych obserwowano równie¿, poza nietolerancj¹ na wy-si³ek fizyczny oraz ogóln¹ s³aboœci¹, obecnoœæ mio-globiny w moczu. Mutacje te charakteryzowa³y siê tym, i¿ wystêpowa³y wy³¹cznie w komórkach miêœniowych, w innych tkankach zmian w genie koduj¹cym cyto-chrom b nie wykazano, co wskazywa³oby na soma-tyczny charakter mutacji. Keightley i wsp. (17) opisali pod³o¿e molekularne wadliwego funkcjonowania III kompleksu bia³kowego ³añcucha oddechowego u pacjentki, u której ju¿ w 1983 r. zdiagnozowano nie-tolerancjê na wysi³ek i kwasicê mleczanow¹. Analiza sekwencji DNA genu MTCYB wykaza³a istnienie mu-tacji G15242A, co powodowa³o utratê a¿ 215 amino-kwasów dojrza³ego bia³ka. Mutacja ta wystêpowa³a w 87% komórek miêœni szkieletowych, natomiast w komórkach krwi obwodowej zanotowano bardzo niski jej odsetek (0,7%). Wystêpowanie tej mutacji, której obecnoœæ wykazano tak¿e w kilku innych tkan-kach, wskazywa³oby na jej pojawienie siê we wczes-nym okresie zarodkowym. Mancuso i wsp. (22) anali-zowali z kolei przyczynê nietolerancji na jakikolwiek wysi³ek u 19-letniej pacjentki; równie¿ w tym przy-padku obserwowane dolegliwoœci by³y spowodowane mutacj¹ mitochondrialnego genu MTCYB. Analiza sekwencji nukleotydowej DNA tego genu wykaza³a pojawienie siê kodonu stop (G15761A), co przek³a-da³o siê na utratê ostatnich 41 aminokwasów bia³ka, modyfikuj¹c istotnie jego funkcje biologiczne. Anali-za PCR-RFLP opisanej mutacji wykaAnali-za³a, ¿e wystê-powa³a ona licznie w miêœniach pacjentki (73%), by³a ledwie wykrywalna w komórkach izolowanych z mo-czu (mniej ni¿ 1%), nie wystêpowa³a natomiast w DNA komórek izolowanych z pe³nej krwi obwodowej. Wczeœniej Brown i wsp. (4) opisali przypadki mutacji punktowych w genie cytochromu b (tranzycje G na A), bêd¹ce przyczyn¹ zmiany struktury bia³ka cyto-chromu b. Efektem tych mutacji jest pojawienie siê encefalopatii zwanej dziedziczn¹ neuropati¹ nerwu wzrokowego Lebera LHON (Leber’s hereditary optic neuropathy). Choroba ta przejawia siê ostr¹ utrat¹ wzroku u m³odych mê¿czyzn i dziedziczona jest po matce. Mutacje genu cytochromu b mog¹ te¿ powo-dowaæ choroby centralnego uk³adu nerwowego. De Coo i wsp. (6) zidentyfikowali delecjê odcinka DNA o d³ugoœci 4 par zasad w wysoce konserwatywnym regionie genu cytochromu b. U pacjenta obarczonego t¹ mutacj¹ powodowa³o to pocz¹tkowo pojawienie siê trudnoœci w koordynacji ruchowej oraz koncentracji, a w póŸniejszym wieku dawa³o obraz typowy dla cho-roby Parkinsona.

Ka¿da z opisanych powy¿ej mutacji upoœledza³a enzymatyczn¹ funkcjê bia³ka cytochromu b i prawid-³owe dzia³anie kompleksu III i tym samym idzie

po-wodowa³a obni¿enie zdolnoœci energetycznej mito-chondriów.

Ewolucja

Wystêpowanie genu koduj¹cego cytochrom b u nie-mal¿e wszystkich organizmów eukariotycznych i roz-maitych organizmów prokariotycznych wskazuje na jego wczesne pojawienie siê w trakcie ewolucji (14, 32). Cytochrom b wystêpuje u eubakterii Gram-dodat-nich i Gram-ujemnych (32) oraz archebakterii (21). Wynika z tego, ¿e gen-przodek musia³ istnieæ zanim nast¹pi³o wyodrêbnienie g³ównych rodów u organiz-mów prokariotycznych (37). Od kiedy ustalono, ¿e gen MTCYB charakteryzuje siê doœæ powolnym tempem zmian w czasie ewolucji (13), sta³ siê on przydatny jako marker genetyczny do ustalania pokrewieñstwa filogenetycznego pomiêdzy gatunkami (16, 18). Cho-cia¿ pewne obszary cytochromu b s¹ bardziej konser-watywne ewolucyjnie, to mo¿na wyró¿niæ regiony wy-kazuj¹ce znaczn¹ zmiennoœæ i w³aœnie one s¹ niezwyk-le cenne do ustalania dystansu filogenetycznego miê-dzy gatunkami i rasami (1, 9, 14).

Praktyczne wykorzystanie

Analiza sekwencji nukleotydowej genu cytochromu b znalaz³a zastosowanie w przypadku okreœlania po-chodzenia œladów biologicznych zwierz¹t i ludzi w ba-daniach s¹dowych oraz nadzorze weterynaryjnym. Przy ustalaniu pochodzenia materia³u biologicznego, jakim s¹ np.: w³osy, pióra, œlady krwi, fragmenty zêbów czy koœci, wykorzystuje siê g³ównie analizy polimorfizmu mitochondrialnego DNA (5, 25). Mo¿liwoœæ analizy materia³u, który wystêpuje w niewielkiej iloœci (w przy-padku, gdy s¹ to fragmenty tkanek b¹dŸ pojedyncze komórki), jak równie¿ materia³u pochodz¹cego ze szcz¹tków kopalnych, jest mo¿liwe dziêki niezwyk³ej stabilnoœci mtDNA i jego powolnej degradacji, st¹d mo¿liwoœæ przeprowadzenia analiz mtDNA pochodz¹-cego ze zmumifikowanych tkanek (26). Na podstawie kopalnych zapisów dla rodowodów niektórych gatun-ków kopytnych mo¿na oszacowaæ tempo ewolucyj-nych zmian ró¿ewolucyj-nych komponentów cytochromu b i sekwencji aminokwasowych. Uda³o siê wykazaæ po-wi¹zania pomiêdzy takimi gatunkami (mog³oby siê wy-dawaæ bardzo odleg³ymi), jak: s³onie, ludzie, byd³o, owce, kozy, ¿yrafy i jelenie (16).

Techniki molekularne oparte na analizie PCR-RFLP tego genu znalaz³y do tej pory zastosowanie, miêdzy innymi, w zakresie nadzoru nad pochodzeniem miêsa i innych produktów konsumpcyjnych pochodzenia zwierzêcego (wykrywanie Ÿród³a pochodzenia miêsa – wo³owina, wieprzowina, drób b¹dŸ wykrywanie ró¿-nego rodzaju zafa³szowañ) (23). Badania te prowadzi siê w³aœnie w oparciu o identyfikacjê na podstawie analizy fragmentu genu cytochromu b. Na podstawie takich analiz mo¿na np. rozró¿niaæ kawior pochodz¹-cy od ró¿nych gatunków jesiotrów (38). Znajduj¹ one tak¿e zastosowanie w logistyce z zakresu ochrony

(4)

przy-Medycyna Wet. 2006, 62 (11) 1232

rody i coraz szerzej na polu filogenetyki, która poszu-kuje odpowiedzi na pytania dotycz¹ce ró¿norodnoœci (19). Dotychczas przeprowadzone analizy cytochro-mu b dotyczy³y ustalenia protoplasty dla konkretnych gatunków. Jako przyk³ad podaæ tu mo¿na badania do-tycz¹ce relacji pomiêdzy ró¿nymi rasami œwiñ, w³¹-czywszy badania nad dawnymi, jak i obecnie wystê-puj¹cymi i powszechnie u¿ytkowanymi rasami (1) czy te¿ badania na materiale pochodzenia zwierzêcego i ludzkiego, w celu okreœlenia mo¿liwoœci wykorzys-tania takich analiz i wskazania stopnia niezawodnoœci w odró¿nianiu œladów ludzkich i zwierzêcych oraz tych pochodz¹cych od gatunków ewolucyjnie pokrewnych (takich jak: ¿ubr, bizon, byd³o domowe, zebu) (26).

Gen cytochromu b charakteryzuje siê du¿¹ konser-watywnoœci¹ (wystêpuje brak zmiennoœci osobniczej). Zmiennoœæ miêdzyosobnicza w obrêbie gatunku ogra-nicza siê jedynie do wystêpowania podstawieñ syno-nimicznych, sta³ych i charakterystycznych dla poszcze-gólnych grup taksonomicznych oraz dla ka¿dego z ga-tunków (26). Z kolei ogromna konserwatywnoœæ sek-wencji bia³ka cytochromu b jest dogodnym narzêdziem do diagnozowania dysfunkcji w mitochondrialnym ³añcuchu oddechowym na modelach mysich (34). Sze-rokie wykorzystanie cytochromu b w tego typu pra-cach nada³o mu status uniwersalnej metryki, co spra-wia, ¿e prowadzone badania mog¹ byæ ³atwo porów-nywalne (19).

Piœmiennictwo

1.Alves E., Óvilo C., Rodríguez M. C., Silió L.: Mitochondrial DNA sequence variation and phylogenetic relationships among Iberian pigs and other domestic and wild pig populations. Anim. Genet. 2003, 34, 319-324.

2.Anderson S., Bankier A. T., Barrell B. G., de Bruijn M. H. L., Coulson A. R., Drouin J., Eperon I. C., Nierlich D. P., Roe B. A., Sanger F., Schreier P. H., Smith A. J. H., Staden R., Young I. G.: Sequence and organization of the human mitochondrial genome. Nature 1981, 290, 457-465.

3.Andreu A. L., Hanna M. G., Reichmann H., Bruno C., Penn A. S., Tanji K., Pallotti F., Iwata S., Bonilla E., Lach B., Morgan-Hughes J., DiMauro S.: Exer-cise intolerance due to mutations in the cytochrome b gene of mitochondrial DNA. N. Engl. J. Med. 1999, 341, 1037-1044.

4.Brown M. D., Voljavec A. S., Lott M. T., Torroni A., Yang C.-C., Wallace D. C.: Mitochondrial DNA complex I and III mutations associated with Leber’s here-ditary optic neuropathy. Genetics 1992, 130, 163-173.

5.Budowle B., Allard M. W., Wilson M. R., Chakraborty R.: Forensics and mito-chondrial DNA: Applications, debates, and foundations. Annu. Rev. Genomics Hum. Genet. 2003, 4, 119-141.

6.De Coo I. F. M., Renier W. O., Ruitenbeek W., Ter Laak H. J., Bakker M., Schagger H., Van Oost B. A., Smeets H. J. M.: A 4-base pair deletion in the mitochondrial cytochrome b gene associated with parkinsonism/MELAS overlap syndrome. Ann. Neurol. 1999, 45, 130-133.

7.Di Rago J. P., Colson A. M.: Molecular basis for resistance to antimycin and diuron, Q-cycle inhibitors acting at the Qi site in the mitochondrial ubiquinol--cytochrome c reductase in Saccharomyces cerevisiae. J. Biol. Chem. 1988, 263, 12564-12570.

8.Drozd L., Karpiñski M., Goleman M., Czy¿owski P.: Charakterystyka krótkich fragmentów restrykcyjnych mtDNA u sarny (Capreolus capreolus) i jelenia szla-chetnego (Cervus elaphus). Ann. Univ. Mariae Curie Sklodowska Sect. EE Zootech. 2003, 56, 23-30.

9.Edwards S. V., Arctander P., Wilson A. C.: Mitochondrial resolution of a deep branch in the genealogical tree for perching birds. Proc. Biol. Sci. 1991, 243, 99-107.

10.Esposti M. D., DeVries S., Crimi M., Ghelli A., Patarnello T., Meyer A.: Mito-chondrial cytochrome b: evolution and structure of the protein. Biochim. Bio-phys. Acta 1993, 1143, 243-271.

11.Gubernator B., Króliczewski J., Rybka J., Szczepaniak A.: Bia³ko Rieskiego – sk³adnik transmembranowych kompleksów cytochromowych. Postêpy Biochem. 1997, 43, 41-50.

12.Hatefi Y., Haavik A. G., Griffiths D. E.: Studies on the Electron Transfer System XLI. Reduced Coenzyme Q-Cytochrome c Reductase. J. Biol. Chem. 1962, 237, 1681-1685.

13.Hauska G., Nitschke W., Herrmann R. G.: Amino acid identities in the three redox center-carrying polypeptides of cytochrome bc1/b6f complexes. J. Bio-energ. Biomembr. 1988, 20, 211-228.

14.Howell N.: Evolutionary conservation of protein regions in the protonmotive cytochrome b and their possible roles in redox catalysis. J. Mol. Evol. 1989, 29, 157-169.

15.Hunte C., Koepke J., Lange C., Rossmanith T., Michel H.: Structure at 2.3 A resolution of the cytochrome bc1 complex from the yeast Saccharomyces cerevi-siae co-crystallized with an antibody Fv fragment. Structure Fold. Des. 2000, 8, 669-684.

16.Irwin D. M., Kocher T. D., Wilson A. C.: Evolution of the cytochrome b gene of mammals. Journal J. Mol. Evol. 1991, 32, 128-144.

17.Keightley J. A., Anitori R., Burton M. D., Quan F., Buist N. R. M., Kenna-way N. G.: Mitochondrial encephalomyopathy and complex III deficiency asso-ciated with a stop-codon mutation in the cytochrome b gene. Am. J. Hum. Genet. 2000, 67, 1400-1410.

18.Kocher T. D., Thomas W. K., Meyer A., Edwarsds S. V., Paabo S., Villablan-ca F. X., Wilson A. C.: Dynamics of mitochondrial DNA evolution in animals: Amplification and sequencing with conserved primers. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1989, 86, 6196-6200.

19.Kvist L.: Phylogeny and phylogeography of European Parids. Acta Univ. Oul. A 2000, 341, 1-51.

20.Link T. A., Schagger H., von Jagow G.: Analysis of the structures of the subunits of the cytochrome bc1 complex from beef heart mitochondria. FEBS Lett. 1986, 204, 9-15.

21.Lubben M., Kolmerer B., Saraste M.: An archaebacterial terminal oxidase com-bines core structures of two mitochondrial respiratory complexes. EMBO J. 1992, 11, 805-812.

22.Mancuso M., Filosto M., Stevens J. C., Patterson M., Shanske S., Krishna S., DiMauro S.: Mitochondrial myopathy and complex III deficiency in a patient with a new stop-codon mutation (G339X) in the cytochrome b gene. J. Neurol. Sci. 2003, 209, 61-63.

23.Matsunaga T., Chikuni K., Tanabeb R., Muroyab S., Shibata K., Yamada J., Shinmura Y.: A quick and simple method for the identification of meat species and meat products by PCR assay. Meat Sci. 1999, 51, 143-148.

24.Mitchell P.: Protonmotive redox mechanism of the cytochrome bc1 complex in the respiratory chain: protonmotive ubiquinone cycle. FEBS Lett. 1975, 56, 1-6. 25.Parson W., Pegoraro K., Niederstatter H., Foger M., Steinlechner M.: Species identification by means of the cytochrome b gene. Int. J. Legal Med. 2000, 114: 23-28.

26.Prusak B., Grzybowski T., Gralak M., Grzybowski G.: Przydatnoœæ analizy sekwencji genu cytochromu b mitochondrialnego DNA do okreœlenia pocho-dzenia œladów biologicznych zwierz¹t i ludzi. Med. Weter. 2005, 61, 162-165. 27.Rieske J. S.: Composition, structure, and function of complex III of the

respira-tory chain. Biochim. Biophys. Acta 1976, 456, 195-247.

28.Romanowska E.: Kompleks cytochromów b/f z b³on chloroplastowych. Postêpy Biochem. 1994, 40, 59-63.

29.Saraste M.: Location of haem-binding sites in the mitochondrial cytochrome b. FEBS Letters 1984, 166, 367-372.

30.Saraste M.: Oxidative phosphorylation at the fin de siecle. Science 1999, 283, 1488-1493.

31.Soriano G. M., Ponamarev M. V., Carrell C. J., Xia D., Smith J. L., Cramer W. A.: Comparison of the cytochrome bc1 complex with the anticipated structure of the cytochrome b6f complex: Le plus ca change le plus c’est la meme chose. J. Bioenerg. Biomembr. 1999, 31, 201-213.

32.Trumpower B. L.: Cytochrome bc1 complexes of microorganisms. Microbiol. Rev. 1990, 54, 101-129.

33.Wallace D. C.: Mitochondrial DNA sequence variation in human evolution and disease. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1994, 91, 8739-8746.

34.Wallace D. C.: Mitochondrial diseases in man and mouse. Science 1999, 283, 1482-1488.

35.Widger W. R., Cramer W. A., Herrmann R. G., Trebst A.: Sequence homology and structural similarity between cytochrome b of mitochondrial complex III and the chloroplast b6f-complex: Position of the cytochrome b hemes in the membrane. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1984, 81, 674-678.

36.Wikstrom M., Krab K., Saraste M.: Proton-translocating cytochrome com-plexes. Ann. Rev. Biochem. 1981, 50, 623-655.

37.Woese C. R.: Bacterial evolution. Microbiol. Rev. 1987, 51, 221-271. 38.Wolf C., Hübner P., Lüthy J.: Differentiation of sturgeon species by PCR-RFLP.

Food Res. Intern. 1999, 32, 699-705.

39.Xia D., Yu C. A., Kim H., Xia J. Z., Kachurin A. M., Zhang L., Yu L., Deisen-hofer J.: The Crystal Structure of the Cytochrome bc1 Complex from Bovine Heart Mitochondria. Science 1997, 277, 60-66.

40.Zawadzka M.: Systemy oceny minisatelitarnego polimorfizmu DNA i mo¿li-woœci ich wykorzystania w hodowli zwierz¹t. Biotechnologia 2000, 4, 62-79. 41.Zhang Z., Huang L., Shulmeister V. M., Chi Y. I., Kim K. K., Hung L. W.,

Crofts A. R., Berry E. A., Kim S. H.: Electron transfer by domain movement in cytochrome bc1. Nature 1998, 392, 677-684.

Adres autora: mgr in¿. Kamila Knapik, ul. Doktora Judyma 12, 71-460 Szczecin

Cytaty

Powiązane dokumenty

Starting with the second day of administration, the egg samples showed the presence of residues up to the end of drug administration (the occurrence of sulphadimidine residues

While in the 4°C group, sheep oocytes reached the MI stage at a rate of 30.6%, the Anaphase- -Telephase I (AI-TI) at 2.1% and the Metaphase II at 15.3% a statistically

Two PCR kits were used in the study: AmpliTaq Gold (Applied Biosystems) with added fluores- cent dyes, and QuantiTect SYBR Green PCR kits (Qiagen). PCR primers were selected from

Pole j¹dra komórek tworz¹cych pierwotne cia³o migda³owate, a nastêpnie j¹dro migda³owate podstaw- no-boczne, podobnie jak pole komórki, ulega powiêk- szeniu podczas

tygodniu ci¹¿y mamy do czynienia z prawie w pe³ni wykszta³conymi wêz³ami, na co wskazuje obecnoœæ nielicznych dojrza³ych limfocytów, zatoki wêz³a s¹ w tym okresie

neralno-witaminowy (zawieraj¹cy chelaty Mg, Mn, Cu, Zn, Fe, Co, Se, witaminy ADE i kompleks witamin z grupy B) stwierdzili wzrost wydajnoœci mlecznej (p £ 0,01) i wy¿sz¹ zawartoœæ

3, korelacja dodatnia wy- stêpuje miêdzy odsetkiem æwiartek z mastitis o etio- logii œrodowiskowej a odsetkiem krów z zapaleniami œrodowiskowymi i miêdzy odsetkiem æwiartek z

Stwierdzono równie¿, ¿e aktywnoœæ en- zymów katalizuj¹cych reakcje glukuronidacji i sulfa- tacji u prze¿uwaczy jest istotnie wiêksza ni¿ u zwie- rz¹t monogastrycznych (2, 9,