Lista wykonywanych badań laboratoryjnych w Zakładzie Mikrobiologii i Immunologii Klinicznej Pracownia Biologii Molekularnej badania PCR

(1)

Lista wykonywanych badań laboratoryjnych w Zakładzie Mikrobiologii i Immunologii Klinicznej – Pracownia Biologii Molekularnej – badania PCR

Lp. Nazwa badania

Tryb zlecania badania

Metoda analityczna

Przybliżony czas

oczekiwania na wynik

Zakres

referencyjny*

Poziom błędów występujących przy oznaczeniu danego typu 1. 1. CMV DNA oznaczenie jakościowe w bioptacie

tkankowym Zwykły Real-time PCR 2 – 4 dni wynik ujemny

(nie wykryto) nie dotyczy 2. 2. CMV DNA oznaczanie jakościowe w płynie

mózgowo-rdzeniowym Zwykły Real-time PCR 2 – 4 dni wynik ujemny

(nie wykryto) nie dotyczy 3. 3.

CMV DNA oznaczenie ilościowe we krwi Zwykły Real-time PCR do 7 dni wynik ujemny

(nie wykryto) ± 0.5 log10

4. 4.

CMV DNA oznaczenie ilościowe w moczu Zwykły Real-time PCR do 7 dni wynik ujemny

5. 5.

EBV DNA oznaczenie ilościowe we krwi Zwykły Real-time PCR do 7 dni wynik ujemny

6. 6.

EBV DNA oznaczenie w bioptacie tkankowym Zwykły Real-time PCR do 7 dni wynik ujemny

(nie wykryto) nie dotyczy 7. 7. HCV RNA oznaczenie jakościowe i ilościowe we

krwi Zwykły Real-time PCR do 14 dni wynik ujemny

8. 8. HBV DNA oznaczenie jakościowe i ilościowe

we krwi Zwykły Real-time PCR do 14 dni wynik ujemny

9. 9. BK/JC DNA oznaczenie jakościowe i ilościowe

we krwi Zwykły Real-time PCR do 7dni wynik ujemny

10. BK/JC DNA oznaczenie jakościowe i ilościowe

w moczu Zwykły Real-time PCR do 7 dni wynik ujemny

10. 11. Toxoplasma gondii DNA oznaczenie

jakościowe we krwi Zwykły

Real-time PCR do 7 dni wynik ujemny

(nie wykryto) nie dotyczy 11. 12. Toxoplasma gondii DNA oznaczenie

jakościowe w płynie mózgowo-rdzeniowym Zwykły

Real-time PCR do 7 dni wynik ujemny

(nie wykryto) nie dotyczy 12. 13. Pneumocystis jirovecii DNA oznaczenie

jakościowe w BAL Zwykły Real-time PCR do 7 dni wynik ujemny

(nie wykryto) nie dotyczy 13. 14. Pneumocystis jirovecii DNA oznaczenie

jakościowe w plwocinie Zwykły Real-time PCR do 7 dni wynik ujemny

(nie wykryto) nie dotyczy 14. 15. Panel 11 wirusów oznaczenie jakościowe w

płynie mózgowo-rdzeniowym Zwykły Real-time PCR 2- 4 dni wynik ujemny

(nie wykryto) nie dotyczy 15. 16. Panel 11 wirusów oznaczenie jakościowe we

krwi Zwykły Real-time PCR 2- 4 dni wynik ujemny

(nie wykryto) nie dotyczy 16. 17. Panel oddechowy oznaczenie jakościowe w

BAL Zwykły Real-time PCR 2-4 dni wynik ujemny

(nie wykryto) nie dotyczy

(2)

17. 18. Panel oddechowy oznaczenie jakościowe w

plwocinie Zwykły Real-time PCR 2-4 dni wynik ujemny

(nie wykryto) nie dotyczy 18. 19. Panel oddechowy oznaczenie jakościowe w

wymazie z noso-gardła Zwykły Real-time PCR 2-4 dni wynik ujemny

(nie wykryto) nie dotyczy 19. 20. SARS-CoV-2 RNA oznaczenie jakościowe w

BAL Cito Real-time PCR do 24 godz.** wynik ujemny

plwocinie Cito Real-time PCR do 24 godz.** wynik ujemny

aspiracie z tchawicy Cito Real-time PCR do 24 godz.** wynik ujemny

wymazie z noso-gardła Cito Real-time PCR do 24 godz.** wynik ujemny

(nie wykryto) nie dotyczy 23. 24. Aspergillus DNA oznaczenie jakościowe w

BAL Zwykły Real-time PCR 2-4 dni wynik ujemny

(nie wykryto) nie dotyczy 24. 25. Aspergillus DNA oznaczenie jakościowe w

płynie mózgowo-rdzeniowym Zwykły Real-time PCR 2-4 dni wynik ujemny

(nie wykryto) nie dotyczy 25. 26. Aspergillus DNA oznaczenie jakościowe we

krwi Zwykły Real-time PCR 2-4 dni wynik ujemny

(nie wykryto) nie dotyczy 26. 27. Candida DNA oznaczenie jakościowe we

krwi Zwykły Real-time PCR 2-4 dni wynik ujemny

(nie wykryto) nie dotyczy 28. Candida DNA oznaczenie jakościowe w

płynie mózgowo-rdzeniowym Zwykły Real-time PCR 2-4 dni wynik ujemny

(nie wykryto) nie dotyczy 29. HHV6/HHV-7 DNA oznaczenie ilościowe we

krwi Zwykły Real-time PCR do 7 dni wynik ujemny

30. HHV-6/HHV-7 DNA oznaczenie ilościowe w

płynie mózgowo-rdzeniowym Zwykły Real-time PCR do 7 dni wynik ujemny

31. Polyomavirus JC DNA oznaczenie w płynie

mózgowo-rdzeniowym Zwykły Real-time PCR do 7 dni wynik ujemny

32. DBS oznaczenie CMV DNA Zwykły Real-time PCR do 14 dni wynik ujemny

* W przypadku mikrobiologicznych badań molekularnych brak jest pojęcia zakresu referencyjnego. Można jedynie stwierdzić wykrycie lub brak materiału genetycznego (tj. kwasu nukleinowego patogenu) w badanej próbce materiału pobranego od pacjenta. Dodatkowo w przypadku oznaczeń ilościowych i wyniku dodatniego mieszczącego się w zakresie liniowości metody, podawany jest ilościowy wynik oznaczenia (kopie/mL lub IU/mL).

** W przypadku dostarczenia materiału do godz. 10:00.

(3)

Lista wykonywanych badań laboratoryjnych w Zakładzie Mikrobiologii i Immunologii Klinicznej – Pracownia Biologii Molekularnej – badania serologiczne

Lp. Nazwa badania Tryb

zlecania

badania Metoda analityczna

Przybliżony czas

oczekiwania na wynik

Zakres referencyjny /Interpretacja

Poziom błędów występujących przy oznaczeniu danego typu 1.

Mycoplasma pneumoniae IgG Zwykły ELISA 7 dni

Wynik:

ujemny <9,0 NTU graniczny 9-11 NTU dodatni ≥ 11,0 NTU

CV 13,32%

2.

Mycoplasma pneumoniae IgM Zwykły ELISA 7 dni

Wynik:

CV 13,13%

3.

Mycoplasma pneumoniae IgA Zwykły ELISA 7 dni

Wynik:

CV 9,84%

4.

Toxoplasma gondii IgG Zwykły

CMIA

24 godziny

Wynik:

ujemny <1,6 IU/mL graniczny 1,6 - <3,0 IU/mL dodatni ≥ 3,0 IU/mL

CV 3,98%

5.

Toxoplasma gondii IgM Zwykły

CMIA

24 godziny

Wynik:

ujemny <0,5 indeks graniczny ≤0,5 - <0,6 indeks dodatni ≥ 0,6 indeks

CV 3,72 %

6.

CMV IgG Zwykły

CMIA

24 godziny

Wynik:

ujemny <6,0 AU/mL dodatni ≥ 6,0 AU/mL

CV 6,17%

7.

CMV IgM Zwykły

CMIA

24 godziny

Wynik:

ujemny <0,85 S/CO graniczny 0,85 - <1 S/CO dodatni ≥ 1,0 S/CO

CV 3,2%

8.

Różyczka (Rubella virus) IgG Zwykły

CMIA

24 godziny

Wynik:

ujemny <4,9 IU/mL graniczny 5,0 - 9,9 IU/mL dodatni ≥ 10,0 IU/mL

CV 14,7%

9. Różyczka (Rubella virus) IgM Zwykły CMIA

24 godziny Wynik:

ujemny <1,2 indeks CV 3,1%

(4)

graniczny ≥1,2 do <1,6 indeks dodatni ≥ 1,6 indeks 10.

ASO (poziom antystreptolizyny O w surowicy) Zwykły Test aglutynacji, lateksowy 24 godziny

Wynik:

ujemny <200 IU/mL, dodatni ≥200 IU/mL

nie dotyczy

11.

Czynnik reumatoidalny - RF Zwykły Test aglutynacji, lateksowy 24 godziny

Wynik:

dodatni ≥8 IU/mL ujemny <8 IU/mL

nie dotyczy

12.

HIV Ag/Ab Combo Zwykły CMIA 24 godziny

Wynik:

ujemny <1,0 S/CO dodatni ≥ 1,0 S/CO

CV 6,01%

13. EBV VCA IgM

Zwykły

CMIA

24 godziny

Wynik:

dodatni ≥1.0 S/CO

graniczny 0,50 do <1.0 S/CO ujemny <0.5 S/CO

CV 2,4%

14. EBV VCA IgG

Zwykły

CMIA

24 godziny

Wynik:

dodatni ≥1,0 S/CO

graniczny 0,75 do <1,0 S/CO ujemny <0,75 S/CO

CV 2,9%

15. EBV EBNA-1 IgG

Zwykły

CMIA

24 godziny

Wynik:

dodatni ≥1.0 S/CO

graniczny 0,50 do <1.0 S/CO ujemny <0.5 S/CO

CV 2,9%

16.

HBsAg (antygen HBs) Zwykły

CMIA

24 godziny

Wynik:

CV 7,9%

17.

Anty-HBs Zwykły

CMIA

24 godziny

Wynik:

ujemny <10 IU/L dodatni ≥ 10 IU/L

CV 13,1%

18.

Anty-HBc Zwykły

CMIA

24 godziny

Wynik:

CV 3,24%

19.

HBeAg (antygen HBe) Zwykły

CMIA

24 godziny

Wynik:

CV 4,86%

20.

Anty-HCV Zwykły

CMIA

24 godziny

Wynik:

CV 5,5%

21. Anty-HBe Zwykły CMIA

24 godziny Wynik:

ujemny >1,0 S/CO CV 3,1%

(5)

dodatni ≤ 1,0 S/CO 22.

Anty-HAV IgM Zwykły CMIA 24 godziny

Wynik:

ujemny <0,8 S/CO graniczny 0,8 – 1,2 S/CO dodatni > 1,2 S/CO

CV 13,1%

23.

Borrelia burgdorferi sensu lato IgG w surowicy Zwykły ELFA 7 dni

Wynik - surowica:

ujemny <0,20 indeks dodatni ≥0,20 indeks

CV % 15,5%

24.

Borrelia burgdorferi sensu lato IgG wpłynie

mózgowo-rdzeniowym Zwykły ELFA 7 dni

IAP, indeks PMR/surowica*:

IAP ≥2 – dooponowe wytwarzanie przeciwciał

* PMR pobrany w tym samym dniu co próbka krwi

Brak danych

25.

Borrelia burgdorferi sensu lato IgM w surowicy Zwykły ELFA 7 dni

Wynik:

ujemny <0,20 indeks wątpliwy 0,20 ≤ - <0,32 dodatni ≥0,32 indeks

CV 9,4%

26.

Borrelia immunoblot IgM - test potwierdzenia Zwykły immunoblot 7 dni

Wynik dodatni - obecność swoistych pasm

antygenowych

nie dotyczy

27.

Borrelia immunoblot IgG - test potwierdzenia Zwykły immunoblot 7 dni

Wynik dodatni - obecność swoistych pasm

antygenowych

nie dotyczy

28.

HSV-1 IgG Zwykły ELISA 7 dni

Wynik:

CV 8,71%

29.

HSV-1/2 IgM Zwykły ELISA 7 dni

Wynik:

CV 12,25%

30.

HSV-2 IgG Zwykły ELISA 7 dni

Wynik:

CV 8,97%

31.

Anty-TP (Treponema pallidum, kiła) Zwykły CMIA 24 godziny

Wynik:

CV 3,6%

32. Aspergillus galactomannan w surowicy - test

Platelia Aspergillus Ag Zwykły ELISA

1-4 dni Wynik:

CV 29,2%

(6)

33. Aspergillus galactomannan w BAL - test Platelia

Aspergillus Ag Zwykły ELISA

1-4 dni Wynik:

CV 19,6%

34.

(1-3)-Beta-D-glukan w surowicy (Fungitell) Zwykły kolorymetria

1-4 dni Wynik ujemny <60 pg/mL Wynik nieokreślony 60-79 pg/mL

Wynik dodatni ≥80 pg/mL

CV 28,9%

35. Cryptococcus antygen w surowicy Zwykły immunochromatografia 24 godziny Wynik dodatni Wynik ujemny

nie dotyczy

36. Cryptococcus antygen w PMR Zwykły immunochromatografia 24 godziny Wynik dodatni

Wynik ujemny

nie dotyczy

37.

Ilościowe oznaczenie SARS-CoV-2 IgG Zwykły CMIA

24 godziny Wynik:

ujemny <50 AU/mL dodatni ≥ 50 AU/mL

CV 4,6%