Aleksandra Wasilewska, stopień doktora
V. KATEDRA MIKROBIOLOGII
Kierownik: prof. dr hab. Józef Kur, prof. zw. PG dr hab. Beata Krawczyk, ad.
dr inż. Anna Brillowska-Dąbrowska, ad.
dr inż. Hubert Cieśliński, ad.
dr inż. Lucyna Holec-Gąsior, ad.
dr inż. Roman Kotłowski, ad.
dr inż. Marcin Olszewski, ad.
dr inż. Rafał Piątek, ad.
dr inż. Paweł Sachadyn, ad.
dr inż. Marta Wanarska, ad.
dr Beata Zalewska-Piątek, ad.
st. tech. Iwona Henke st. ref. tech. Anna Wójcikowska Doktoranci:
mgr inż. Michał Banasik (od 1.10.2009) mgr inż. Paulina Bartasum (od 1.10.2009) mgr inż. Dorota Drapała (od 1.10.2009) mgr inż. Ewa Hildebrandt
mgr inż. Piotr Hildebrandt mgr inż. Marta Kur (do 30.09. 2009)
mgr inż. Justyna Leibner – Ciszak (do 30.09. 2009) mgr inż. Małgorzata Mickiewicz
mgr inż. Anna Mielech
mgr inż. Marta Nowak (od 1.10.2009) mgr inż. Paulina Rakowska (od 1.10.2009) mgr inż. Karolina Stojowska
mgr inż. Katarzyna Werbowy mgr inż. Sabina Wilkanowicz
•
••
1.2.
3.
4.
1.2.
3.
••
Tematyka prowadzonych badań naukowych:
Obecna działalność naukowo-badawcza związana jest z zagadnieniami związanymi głównie z biologią molekularną, biotechnologią medyczną i przemysłową, wykorzystującymi techniki rekombinacji DNA in vitro. Realizowane badania obejmują trzy tematy: (1) diagnostyka molekularna, (2) molekularne mechanizmy patogenności mikroorganizmów i (3) metagenomika i organizmy ekstremofilne.
W ramach tematu dotyczącego diagnostyki molekularnej opracowywane i adaptowane są nowe metody molekularne pozwalające genetycznie bądź serologicznie identyfikować i różnicować drobnoustroje. Do typowania genetycznego głównie wykorzystuje się opracowane w katedrze techniki PCR MP, ADSRRS – fingerprinting oraz techniki standardowe REA-PFGE i RAPD.
Opracowywane są nowe metody oparte na technice PCR do identyfikacji i różnicowania klinicznie ważnych organizmów grzybowych z rodzaju Candida, Trichophyton i Aspergillus. Opracowywane są nowe narzędzia diagnostyczne do immunodiagnostyki toksoplazmozy z wykorzystaniem antygenów rekombinantowych pasożyta otrzymywanych metodami inżynierii genetycznej i biologii molekularnej, mogących znaleźć zastosowanie w rozpoznawaniu zarażenia T. gondii u ludzi oraz fazy choroby, co ma niebagatelne znaczenie kliniczne.
Badania molekularnych mechanizmów patogenności mikroorganizmów dotyczą operonu dra uropatogennych szczepów Escherichia coli oraz wykorzystania zdobytej wiedzy w tym zakresie do projektowania, syntezy i badania nowej klasy związków przeciw-bakteryjnych hamujących proces biogenezy fimbrii, będących czynnikami wirulencji.
Badania w temacie metagenomika i organizmy ekstremofilne dotyczą adaptowanych do zimna β-galaktozydaz oraz enzymów lipolitycznych o dużym potencjale biotechnologicznym; zastosowań genu markerowego rsfp, uzyskanego z metagenomu gleby antarktycznej w technikach biologii molekularnej adaptowanych do zimna organizmów; izolacji i molekularnej charakterystyki plazmidów bakterii psychrofilnych/psychrotrofowych oraz konstrukcji wektorów wahadłowych dla systemów ekspresyjnych do wydajnej produkcji psychrozymów w bakteriach psychrofilnych/psychrotrofowych;
izolacji i charakterystyki białek SSB, RecA i MutS i wykorzystaniem ich jako narzędzia w technikach biologii molekularnej.
Ponadto, rozpoczęto badania dotyczące molekularnych podstaw regeneracji ssaków, obecnie prowadzone są eksperymenty badania metylacji regionów regulatorowych wybranych genów potencjalnie istotnych w procesie regeneracji.
WYNIKI DZIAŁALNOŚCI NAUKOWEJ
PUBLIKACJE W CZASOPISMACH WYRÓŻNIONYCH PRZEZ JOURNAL CITATION REPORTS A cryptic ribosome binding site, false signals in reporter systems and avoidance of protein translation chaos / Sachadyn P., Stanisławska - Sachadyn A., Kabat E.M., Zielińska A., Kur J. // Journal of Biotechnology. - Vol. 143, nr 3 (2009), s. 169-172 JCR 83303 1.
Stan kadr / liczba
Profesor zwyczajny
Profesor nadzwyczajny 0
Profesor wizytujący 0
Docent
Adiunkt 0
Asystent 0
Starszy wykładowca 0
Wykładowca 0
Tytuły i stopnie naukowe / liczba
Profesor
Doktor habilitowany
Doktor 0
A new β-D-galactosidase with a low temperature optimum isolated from the Antarctic Arthrobacter sp. 20B: gene cloning, purification and characterization. / Białkowska A., Cieśliński H., Nowakowska K., Kur J., Turkiewicz M. // Archives of Microbiology. - Vol. 191, iss. 11 (2009), s. 825-35 JCR 83293 An MTA-phosphorylase gene discovered in the metagenomic library derived from Antarctic top soil during screening for lipolytic active clones confers strong pink fluorescence in the presence of rhodamine B. / Cieśliński H., Długołecka A., Kur J., Turkiewicz M. // FEMS Microbiology Letters. - Vol. 292, iss. 2 (2009), s. 232-40 JCR 83291 Antarctic, cold-adapted beta-galactosidase of Pseudoalteromonas sp. 22b as an effective tool for alkyl galactopyranosides synthesis / Makowski K., Białkowska A., Olczak J., Kur J.W., Turkiewicz M. // Enzyme and Microbial Technology. - Vol. 44 (2009), s. 59-64 2.
3.
4.
JCR 84015 Hildebrandt P., Wanarska M., Kur J.: A new cold-adapted beta-D-galactosidase from the Antarctic Arthrobacter sp. 32c - gene cloning, overexpression, purification and properties //
BMC Microbiology. - Vol. 9, nr art. 151 (2009), s. [1-11] JCR 83334 Holec-Gąsior L., Kur J.W., Hiszczyńska-Sawicka E.: GRA2 and ROP1 recombinant antigens as potential markers for detection of Toxoplasma gondii - specific immunoglobulin G in humans with acute toxoplasmosis. // Clinical and Vaccine Immunology. - Vol. 16, No. 4
(2009), s. 510-514 JCR 83337
Kur J.W., Holec-Gąsior L., Hiszczyńska-Sawicka E.: Current status of toxoplasmosis vaccine development // Expert Review of Vaccines. - Vol. 8, No. 6 (2009), s. 791-808 JCR 83335 PCR melting profile (PCR MP) - a new tool for differentiation of Candida albicans strains / Krawczyk B., Leibner-Ciszak J., Mielech A., Nowak M., Kur J.W. // BMC Infectious Diseases.
- Vol. 9, no. 177, (2009) JCR 83551 Preclusion of irreversible destruction of Dr adhesin structures by a high activation barrier for the unfolding stage of the fimbrial DraE subunit / Piątek R., Bruzdziak P., Zalewska-Piątek B., Kur J., Stangret J. // Biochemistry. - Vol. 48, iss. 49 (2009), s. 11807-11816 JCR 84022 Retained features of embryonic metabolism in the adult MRL mouse / Naviaux R.K., Le T., Bedelbaeva K., Leferovich J., Gourevitch D., Sachadyn P., Zhang X., Lise C., Ellen H. //
Molecular Genetics and Metabolism. - Vol. 96, iss. 3 (2009), s. 133-144 JCR 83304 Retrospective analysis of genetic diversity of Klebsiella oxytoca isolated in Poland over a 50-year period. / Stojowska K., Krawczyk B., Kałużewski S., Kur J.W. // European Journal of Clinical Microbiology and Infectious Diseases. - Vol. 28, iss. 10 (2009), s. 1263-1266 JCR 83614 Structure of EstA esterase from psychrotrophic Pseudoalteromonas sp. 643A covalently inhibited by monoethylphosphonate. / Brzuszkiewicz A., Nowak E., Dauter Z., Dauter M., Cieśliński H., Długołęcka A., Kur J. // Acta Crystallographica : Section F : Structural Biology and Crystallization Communications. - Vol. 65, iss. 9 (2009), s. 862-865 JCR 83290 Werbowy K., Cieśliński H., Kur J.: Characterization of a cryptic plasmid pSFKW33 from Shewanella sp. 33b // Plasmid. - Vol. 62, iss. 1 (2009), s. 44-49 JCR 83289 PUBLIKACJE W INNYCH CZASOPISMACH RECENZOWANYCH KRAJOWYCH I ZAGRANICZNYCH Biofilm formation as a virulence determinant of uropathogenic Escherichia coli Dr+ strains / Zalewska-Piątek B.M., Wilkanowicz S.I., Piątek R.J., Kur J.W. // Polish Journal of Microbiology. - Vol. 58, nr 3 (2009), s. 223-229 JC 83472 Brillowska-Dabrowska A.: Nowoczesne metody diagnostyki zakażeń dermatofitowych //
Mikologia Lekarska. - Vol. 16, nr 1 (2009), s. 47-49 AR 82551 Hiszczyńska-Sawicka E., Holec-Gąsior L., Kur J.W.: Szczepionki DNA i antygeny rekombinantowe w prewencji zarażeń Toxoplasma gondii : aktualny stan badań //
Wiadomości Parazytologiczne. - Vol. 55, z. 2 (2009), s. 125-139 AR 83339 Holec-Gąsior L., Kur J.W.: Badania epidemiologiczne populacji kobiet gminy Przodkowo w kierunku toksoplazmozy // Przegląd Epidemiologiczny. - T. 63, nr 2 (2009), s. 311-316 AR 83341 Identification and molecular modeling of a novel lipase from an Antarctic soil metagenomic library. / Cieśliński H., Białkowska A., Tkaczuk K., Długołęcka A., Kur J.W., Turkiewicz M. //
Polish Journal of Microbiology. - Vol. 58, nr 3 (2009), s. 199-204 JC 83301 Olszewski M., Filipkowski P.: Benzonaza(R): możliwości praktycznych zastosowań. //
Postępy Biochemii. - T. 55, nr 1 (2009), s. 21-24 AR 82549
Purification and biochemical characteristic of a cold-active recombinant esterase from Pseudoalteromonas sp. 643A under denaturing conditions. / Długołęcka A., Cieśliński H., Bruździak P., Gottfried K., Turkiewicz M., Kur J.W. // Polish Journal of Microbiology. - Vol.
58, nr 3 (2009), s. 211-218 [por.poz.1 str.66] JC 83302 Stojowska K., Kałużewski S., Krawczyk B.: Usefulness of PCR Melting Profile Method for Genotyping Analysis of Klebsiella oxytoca Isolates from Patients of a Single Hospital Unit //
Polish Journal of Microbiology. - Vol. 58, nr 3 (2009), s. 247-253 JC 83557 MONOGRAFIE I PODRĘCZNIKI AKADEMICKIE W J. ANGIELSKIM
Lucyna Holec-Gąsior, Katarzyna Werbowy, Józef Kur.: Laboratory Exercises in Microbiology.
– Gdańsk: Wydaw. PG (2008), s. 1-105 / Nie ujęto w Raporcie za rok 2008.
PA 84597