POLITECHNIKA SU\SKA
WYDZIAL AUTOMATYKI, ELEKTRONIKII INFORMATYKI
Selection of miRNA isoform markers differentiating between
follicular thyroid cancer and follicular thyroid adenoma from
high-throughput sequencing data
Autor: mgr inz. Tomasz Stokowy
Promotor: dr hab. inz. Krzysztof Fujarewicz, prof. nzw. Politechniki Slqskiej
Politechnika Slqska w Gliwicach, Instytut Automatyki
Promotor pomocniczy: dr n. med. Michat Jarz^b
Centrum Onkologii - Instytut im. Marii Sktodowskiej - Curie Oddziat w Gliwicach, III Klinika Radioterapii і Chemioterapii
Praca doktorska
Gliwice, kwiecieri 2013І
INNOWACYJNA GOSPODARKA f u n d a c / a п а г / л / N a u k t P o l i k t r iFN P
ш
U N IA E U R O P E J S K AE U R O P E JS K t F U N D U S ZStreszczenie rozprawy doktorskiej (w j^zyku polskim)
Selekcja izoform miRNA jako markerow roznicujqcych pomi$dzy rakiem PQcherzykowym tarczycy a gruczolakiem p^cherzykowym tarczycy na podstawie danych z sekwencjonowania wysokiej przepustowosci.
Drugim najcz^sciej diagnozowanym ztosliwym guzem tarczycy jest rak pqcherzykowy (FTC), diagnozowany w 10-20% przypadkow raka tarczycy, w zaleznosci od badanej populacji. Ze wzgl^du na jego histologiczne і cytologiczne podobienstwo do tagodnego gruczolaka p^cherzykowego tarczycy (FA) konieczne jest wskazanie nowych markerow molekularnych roznicujqcych te dwa nowotwory.
Gtownym celem pracy jest selekcja markerow miRNA roznicujgcych pomi^dzy rakiem p^cherzykowym tarczycy (FTC) і gruczolakiem p^cherzykowym tarczycy (FA).
Cel pracy realizowany byt poprzez wykorzystanie samodzielnie zaprojektowanego і zaimplementowanego oprogramowania stuzgcego do analizy danych z sekwencjonowania wysokiej przepustowosci.
Wynikiem pracy byto wskazanie hsa-miR-7-5p,hsa-miR-486-5p, hsa-miR-151a-5p і hsa-miR- 139-5p jako najistotniejszych markerow ztosliwosci guzow pqcherzykowych tarczycy na podstawie danych pochodz^cych z gt^bokiego sekwencjonowania. Ocena klasyfikatora opartego о powyzsze miRNA data w rezultacie wyniki doktadnosci klasyfikacji rownej 0,82, specyficznosci 0,94 і negatywnej wartosci predykcyjnej rownej 0,67.
Wyniki pracy prowadzq do optymistycznych oczekiwan, ze zaproponowane markery miRNA poprawig mozliwosci diagnostyczne і zostang wprowadzone do praktyki klinicznej.
