Modelowanie molekularne
metodami chemii kwantowej
Dr hab. Artur Michalak Zakład Chemii Teoretycznej
Wydział Chemii UJ
http://www.chemia.uj.edu.pl/~michalak/mmod2007/
Wykład 7
Ck08
• Podstawowe idee i metody chemii kwantowej:
Funkcja falowa, gęstość elektronowa; równanie Schrodingera; Teoria Funkcjonałów Gęstości (DFT);
przyblienie Borna-Oppenheimera, zasada wariacyjna w mechanice kwantowej i w DFT, przyblienie
jednoelektronowe; metoda HF; korelacja elektronowa; metody korelacyjne oparte na funkcji falowej; metoda Kohna-Shama
• Dane do obliczeń kwantowo-chemicznych; GAMESS:
Geometria czasteczki; macierz Z; bazy funkcyjne
w obliczeniach ab initio ; input/output programu GAMESS
• Struktura geometryczna układów molekularnych:
Optymalizacja geometrii; optymalizacja z wiazami;
analiza konformacyjna; problem minimum globalnego
• Struktura elektronowa układów molekularnych:
Orbitale molekularne, orbitale KS; wiazanie chemiczne;
gęstość różnicowa; orbitale zlokalizowane;
analiza populacyjna; analiza rzędów wiązań
• Analiza wibracyjna; Wielkości termodynamiczne; Reaktywność chemiczna:
Analiza wibracyjna; wielkosci termodynamiczne; modelowanie reakcji chemicznych;
optymalizacja geometrii stanu przejściowego, IRC; indeksy reaktywności chemicznej,
molekularny potencjał elektrostatyczny, funkcja Fukui’ego i teoria orbitali granicznych; jedno- i dwu-reagentowe indeksy reaktywności
• Inne zagadnienia:
Metody hybrydowe QM/MM; modelowanie wielkich układów; efety rozpuszczalnika;
modelowanie w katalizie homo- i heterogenicznej; oddziaływania międzycząsteczkowe, i. in.
Struktura elektronowa
Ł Ł adunki atom adunki atom ó ó w i rz w i rz ę ę dy wi dy wi ą ą za za ń ń
• nawiązują do tradycyjnie używanych w chemii pojeć
• nie są obserwablami
• rożne metody obliczania ładunków na atomach i rzędów wiązań
• zależność uzyskanych wartości od metody i bazy funkcyjnej
Ł Ł adunki atom adunki atom ó ó w i rz w i rz ę ę dy wi dy wi ą ą za za ń ń
Intuicyjne ‘definicje’:
• ładunek atomu = ładunek jądra - populacja elektronowa atomu (‘ilość elektronów na atomie’)
• rząd wiązania = ilość par elektronowych wiążących dwa
wybrane atomy [jak we wzorach strukturalnych cząsteczek];
ilość par elektronowych w obszarach ‘pomiędzy atomami’
C C H
H
H H
C C
H H
2
1 3 1
Ł Ł adunki atom adunki atom ó ó w i rz w i rz ę ę dy wi dy wi ą ą za za ń ń
niejednoznaczność podziału gęstości cząsteczki pomiędzy tworzące ją atomy i wiązania chemiczne wynika z niejednoznaczności definicji atomu w cząsteczce
Ł Ł adunki atom adunki atom ó ó w i rz w i rz ę ę dy wi dy wi ą ą za za ń ń
Gęstość elektronowa w benzenie
niejednoznaczność podziału gęstości cząsteczki pomiędzy tworzące ją atomy i wiązania chemiczne wynika z niejednoznaczności definicji atomu w cząsteczce
Ł Ł adunki atom adunki atom ó ó w i rz w i rz ę ę dy wi dy wi ą ą za za ń ń
alternatywne definicje atomów w cząsteczce oparte na
‘podziale’ cząsteczki na atomy w przestrzeni fizycznej lub w przestrzeni funkcyjnej (poprzez funkcje bazy)
Gęstość elektronowa w benzenie
∫
=
A
A
r dr
N ρ ( )
) ,....](
, [
)
( r ρ χ
Aχ
Br
ρ =
Analiza populacyjna Analiza populacyjna
Analiza populacyjna Mullikena (baza nieortogonalna)
Analiza populacyjna Analiza populacyjna
Analiza populacyjna Löwdina (baza ortogonalizowana)
( )
p qq p
s
p s
p
s
p q
q p p
p s
p
s
q
q p
P
P P
P r
N
, ,
1 p 1
, ,
1 1
)
,(
1/2 1/2
PS
= S
℘
=
+
=
=
= ∫ ∑∑ ∑ ∑ ∑
=
= ≠
= =
ρ
∑
∈
℘
−
=
α α
α
p
Z
Q
pAnaliza populacyjna Analiza populacyjna
Analiza populacyjna Mullikena
Teoria AIM Badera Teoria AIM Badera ( ( Atoms Atoms in in Molecules Molecules ) )
• podział gęstości elektronowej w przestrzeni fizycznej w oparciu o pochodne i punkty krytyczne gęstości elektronowej.
R.F.W. Bader, „Theory of Atoms in Molecules”
http://www.chemistry.mcmaster.ca/faculty/bader/aim/
Teoria AIM Badera Teoria AIM Badera ( ( Atoms Atoms in in Molecules Molecules ) )
R.F.W. Bader, „Theory of Atoms in Molecules”
http://www.chemistry.mcmaster.ca/faculty/bader/aim/
Analiza populacyjna Analiza populacyjna
Analiza Hirshfelda
• w przestrzeni fizycznej, ale bez podziału przestrzeni pomiędzy poszczególne atomy
• każdy punkt przestrzeni „należy” po cześci do każdego atomu
• pojecie promolekuły: „molekuła” złożona z
nieoodziaływających atomów umieszczonych w pozycjach takich jak w molekule
Analiza populacyjna Analiza populacyjna
Analiza Hirshfelda
• w przestrzeni fizycznej, ale bez podziału przestrzeni pomiędzy poszczególne atomy
• każdy punkt przestrzeni „należy” po cześci do każdego atomu
• pojecie promolekuły: „molekuła” złożona z
nieoodziaływających atomów umieszczonych w pozycjach takich jak w molekule
r
A B
Analiza populacyjna Analiza populacyjna
Analiza Hirshfelda
• w przestrzeni fizycznej, ale bez podziału przestrzeni pomiędzy poszczególne atomy
• każdy punkt przestrzeni „należy” po cześci do każdego atomu
• pojecie promolekuły: „molekuła” złożona z
nieoodziaływających atomów umieszczonych w pozycjach takich jak w molekule
r
A B
ρ ρ ρ
ρ
ΑΑΑΑ0 0 0 0 (r)ρ ρ ρ ρ
ΒΒΒΒ0 0 0 0 (r)Analiza populacyjna Analiza populacyjna
Analiza Hirshfelda
• w przestrzeni fizycznej, ale bez podziału przestrzeni pomiędzy poszczególne atomy
• każdy punkt przestrzeni „należy” po cześci do każdego atomu
• pojecie promolekuły: „molekuła” złożona z
nieoodziaływających atomów umieszczonych w pozycjach takich jak w molekule
r
A B
ρ ρ ρ
ρ
ΑΑΑΑ0 0 0 0 (r)ρ ρ ρ ρ
ΒΒΒΒ0 0 0 0 (r)ρ ρ ρ
ρ
0 0 0 0 (r) =ρ ρ ρ ρ
ΑΑΑΑ0 0 0 0 (r) + + + +ρ ρ ρ ρ
ΒΒΒΒ0 0 0 0 (r)Analiza populacyjna Analiza populacyjna
Analiza Hirshfelda
• w przestrzeni fizycznej, ale bez podziału przestrzeni pomiędzy poszczególne atomy
• każdy punkt przestrzeni „należy” po cześci do każdego atomu
• pojecie promolekuły: „molekuła” złożona z
nieoodziaływających atomów umieszczonych w pozycjach takich jak w molekule
r
A B
ρ ρ ρ
ρ
ΑΑΑΑ0 0 0 0 (r)ρ ρ ρ ρ
ΒΒΒΒ0 0 0 0 (r)ρ ρ ρ
ρ
0 0 0 0 (r) =ρ ρ ρ ρ
ΑΑΑΑ0 0 0 0 (r) + + + +ρ ρ ρ ρ
ΒΒΒΒ0 0 0 0 (r)Udział atomu X w gestości promolekuły: wX(r) =
ρ ρ ρ ρ
X0 0 0 0 (r) /ρ ρ ρ ρ
0 0 0 0 (r)Analiza populacyjna Analiza populacyjna
Analiza Hirshfelda
• w przestrzeni fizycznej, ale bez podziału przestrzeni pomiędzy poszczególne atomy
• każdy punkt przestrzeni „należy” po cześci do każdego atomu
• pojecie promolekuły: „molekuła” złożona z
nieoodziaływających atomów umieszczonych w pozycjach takich jak w molekule
r
A B
ρ ρ ρ
ρ
ΑΑΑΑ0 0 0 0 (r)ρ ρ ρ ρ
ΒΒΒΒ0 0 0 0 (r)ρ ρ ρ
ρ
0 0 0 0 (r) =ρ ρ ρ ρ
ΑΑΑΑ0 0 0 0 (r) + + + +ρ ρ ρ ρ
ΒΒΒΒ0 0 0 0 (r)Udział atomu X w gestości promolekuły: wX(r) =
ρ ρ ρ ρ
X0 0 0 0 (r) /ρ ρ ρ ρ
0 0 0 0 (r) Molekularna gęstość el.ρ ρ ρ ρ
(r) w kazdym punkciedzielona pomiędzy atomy
n
X(r)
=w
X(r) ρ ρ ρ ρ (r)
Analiza populacyjna Analiza populacyjna
Analiza Hirshfelda
• w przestrzeni fizycznej, ale bez podziału przestrzeni pomiędzy poszczególne atomy
• każdy punkt przestrzeni „należy” po cześci do każdego atomu
• pojecie promolekuły: „molekuła” złożona z
nieoodziaływających atomów umieszczonych w pozycjach takich jak w molekule
r
A B
ρ ρ ρ
ρ
ΑΑΑΑ0 0 0 0 (r)ρ ρ ρ ρ
ΒΒΒΒ0 0 0 0 (r)ρ ρ ρ
ρ
0 0 0 0 (r) =ρ ρ ρ ρ
ΑΑΑΑ0 0 0 0 (r) + + + +ρ ρ ρ ρ
ΒΒΒΒ0 0 0 0 (r)Udział atomu X w gestości promolekuły: wX(r) =
ρ ρ ρ ρ
X0 0 0 0 (r) /ρ ρ ρ ρ
0 0 0 0 (r) Molekularna gęstość el.ρ ρ ρ ρ
(r) w kazdym punkciedzielona pomiędzy atomy
n
X(r)
=w
X(r) ρ ρ ρ ρ (r)
Analiza populacyjna Analiza populacyjna
Analiza Hirshfelda
Molekularna gęstość el.
ρ ρ ρ ρ
(r) w kazdym punkcie dzielona pomiędzy atomy:n
X(r)
=w
X(r) ρ ρ ρ ρ (r); N
X= ∫∫∫∫ w
X(r) ρ ρ ρ ρ (r) dr
Analiza populacyjna Analiza populacyjna
Analiza Hirshfelda
Molekularna gęstość el.
ρ ρ ρ ρ
(r) w kazdym punkcie dzielona pomiędzy atomy:n
X(r)
=w
X(r) ρ ρ ρ ρ (r); N
X= ∫∫∫∫ w
X(r) ρ ρ ρ ρ (r) dr
Zwiazki z teorią informacji:
Roman F. Nalewajski i Elżbieta Broniatowska
• nawiązują do tradycyjnie używanych w chemii pojeć (wiązanie pojedyncze, podwójne, itd.)
• rząd wiązania nie jest obserwablą
• rożne metody obliczania indeksów krotności wiązań
• zależność uzyskanych wartości od metody i bazy funkcyjnej
Rz Rz ę ę dy wi dy wi ą ą za za ń ń
C C H
H
H H
C C
H H
• intuicyjna definicja w ramach teorii MO b = (n – n*)/2
n - liczba elektronów na orbitalach wiążących;
n* - liczba elektronów na orb. antywiążących
• intuicyjna definicja w ramach teorii MO b = (n – n*)/2
n - liczba elektronów na orbitalach wiążących;
n* - liczba elektronów na orb. antywiążących
Rz Rz ę ę dy wi dy wi ą ą za za ń ń
Cząsteczka O 2
z
σ1s1s
1sO2
2sO1 2sO2
2pO1 2pO2
1sO1
σ∗1s1s σ2s2s
σ∗2s2s σ2pz2pz σ∗2pz2pz
π2px2px π2py2py π∗2px2px π∗2py2py
b = 2
b = 2
• intuicyjna definicja w ramach teorii MO b = (n – n*)/2
n - liczba elektronów na orbitalach wiążących;
n* - liczba elektronów na orb. antywiążących
trudna do stosowania w cząsteczkach wieloatomowych z silnie zdelokalizowanymi orbitalami molekularnymi
• intuicyjna definicja w ramach teorii MO b = (n – n*)/2
n - liczba elektronów na orbitalach wiążących;
n* - liczba elektronów na orb. antywiążących
trudna do stosowania w cząsteczkach wieloatomowych z silnie zdelokalizowanymi orbitalami molekularnymi
Rz Rz ę ę dy wi dy wi ą ą za za ń ń
CnC T
P =
• elementy macierzy P (tzw. ‘macierz rzedów wiązań i ładunków‘
(‘charge and bond-order-matrix’, CBO matrix)
Uzyskane wartości nie odpowiadają intuicyjnym (wiązanie pojedyncze, podwójne, itp.)
Coulson, 1939
Rz Rz ę ę dy wi dy wi ą ą za za ń ń
∑∑ ( )
∈ ∈
=
A
a b B
ab
AB
P
b
2• definicja Wiberga – kwadraty P
Wiberg. K. Tetrahedron, 1968, 24, 1093.
Rz Rz ę ę dy wi dy wi ą ą za za ń ń
∑∑ ( )
∈ ∈
=
A
a b B
ab
AB
P
b
2Wiberg. K. Tetrahedron, 1968, 24, 1093.
- metody półempirtyczne
- kwadraty P - wagi przy przyczynkach do energiii wymiennej
∑∑
∈ ∈
−
=
A a b B
ab ab ex
AB P
E 2γ
2 1
Rz Rz ę ę dy wi dy wi ą ą za za ń ń
• definicja Wiberga – kwadraty P
CNDO:
∑∑ ( )
∈ ∈
=
A
a b B
ab
AB
P
b
2Rz Rz ę ę dy wi dy wi ą ą za za ń ń
• definicja Wiberga – kwadraty P
∑∑ ( )
∈ ∈
=
A
a b C
ab
AB
P
b
2( )
p qq
Pp, = S1/2PS1/2 ,
• definicja Gopinathana i Juga (G-J)
Gopinathan M.S.; Jug, K. Theoret. Chim. Acta 1983, 63, 497.
- metody ab initio
- definicja pokrewna do Wiberga- w ortogonalizowanej bazie AO
Rz Rz ę ę dy wi dy wi ą ą za za ń ń
( ) ( )
∑∑
∈ ∈
=
A
a b C
ba ab
b
ABPS PS
•
Mayer
Mayer, I. Chem. Phys. Lett. 1984, 97, 270.
Rz Rz ę ę dy wi dy wi ą ą za za ń ń
- metody ab initio
- definicja pokrewna do Wiberga- w nieortogonalnej bazie
• Wiberg, Gopinathan-Jug, Mayer
- atom określony przez zbiór funkcji bazy scentrowanych na tym atomie
- silna zalezność od bazy funkcyjnej (jak dla analizy populacyjnej) - problemy z układami opartymi na metalach przejściowych –
(wymagajacymi duzych baz)
Rz Rz ę ę dy wi dy wi ą ą za za ń ń
Nalewajski, R.F.; Koster, A. M.; Jug K. Theor. Chim. Acta 1993, 85, 463.
Nalewajski, R.F.; Mrozek, J.; Formosinho, S. J.; Varandas, A. J. C.
International Journal of Quantum Chemistry 1994, 52, 1153.
Nalewajski, R.F.; Mrozek, J. International Journal of Quantum Chemistry 1994, 51, 187.
Nalewajski, R.F.; Mrozek, J. International Journal of Quantum Chemistry 1996, 57, 377.
Nalewajski, R.F.; Mrozek, J.; Mazur, G. Can. J. Chem. 1996, 74, 1121.
Nalewajski, R.F.; Mrozek, J.; Michalak, A. International Journal of Quantum Chemistry 1997, 61, 589.
Nalewajski, R.F.; Mrozek, J.; Michalak, A. Polish J. Chem 1998, 72, 1779.
Teoria wartosciowości chemicznej Nalewajskiego i Mrozka
Rz Rz ę ę dy wi dy wi ą ą za za ń ń
• R.F. Nalewajski Podstawy i metody chemii kwantowej. PWN 2001.
• Nalewajski i Mrozek (IJQC, 1994, 51, 187)
Rz Rz ę ę dy wi dy wi ą ą za za ń ń
Wartościowość chemiczna – wielkość różnicowa;
okreslająca zmiany w przyczynkach kwadratowych do elementów diagonalnych w parach dwu-elektronowej
w molekule w stosunku do promolekuły
Nalewajski, R.F.; Mrozek, J. International Journal of Quantum Chemistry 1994, 51, 187
}) ({
2) 2 (
P
νµ∆
∆
=
∆ Γ Γ
Rz Rz ę ę dy wi dy wi ą ą za za ń ń (N (N - - M) M)
Wartościowość chemiczna – wielkość różnicowa;
okreslająca zmiany w przyczynkach kwadratowych do elementów diagonalnych w parach dwu-elektronowej
w molekule w stosunku do promolekuły
Rz Rz ę ę dy wi dy wi ą ą za za ń ń (N (N - - M) M)
( ) { ( ) ( ) }
− ∆ + ∆ + ∆
=
∑
Aa
aa aa
A i
A n P P
V 2 2 2
2
1 α β
( ) ( )
[ ]
∑∑
<
∆ +
∆
=
A
a A
a
aa aa
c
A P P
V
'
2 ' 2
'
β α
b A i
AB n n
V = −∆ ∆
( ) ( )
[ ]
∑∑
∆ + ∆=
A
a B
b
ab ab
c
AB P P
V α 2 β 2
Indeksy wartościowości:
Nalewajski, R.F.; Mrozek, J. International Journal of Quantum Chemistry 1994, 51, 187
Rz Rz ę ę dy wi dy wi ą ą za za ń ń (N (N - - M) M)
( ) { ( ) ( ) }
− ∆ + ∆ + ∆
=
∑
Aa
aa aa
A i
A n P P
V 2 2 2
2
1 α β
( ) ( )
[ ]
∑∑
<
∆ +
∆
=
A
a A
a
aa aa
c
A P P
V
'
2 ' 2
'
β α
b A i
AB n n
V = −∆ ∆
( ) ( )
[ ]
∑∑
∆ + ∆=
A
a B
b
ab ab
c
AB P P
V α 2 β 2
Nalewajski, R.F.; Mrozek, J. International Journal of Quantum Chemistry 1994, 51, 187
∑∑
∑
≠
+
=
A B
AB A
A
V
V
Całkowita wartościowośc:
V
Rz Rz ę ę dy wi dy wi ą ą za za ń ń (N (N - - M) M)
Indeksy wartościowości:
( )
{
( ) ( )}
− ∆ + ∆ + ∆
= ∑A
a
aa aa
A i
A n P P
V 2 2 2
2
1 α β
( ) ( )
[ ]
∑ ∑
<
∆ +
∆
=
A
a A
a
aa aa
c
A P P
V
'
2 ' 2
'
β α
b A i
AB n n
V = −∆ ∆
( ) ( )
[ ]
∑ ∑ ∆ + ∆
=
A
a B
b
ab ab
c
AB P P
V α 2 β 2
Nalewajski, R.F.; Mrozek, J.; Mazur, G. Can. J. Chem. 1996, 74, 1121.
Nalewajski, R.F.; Mrozek, J.; Michalak, A. International Journal of Quantum Chemistry 1997, 61, 589.
Nalewajski, R.F.; Mrozek, J.; Michalak, A. Polish J. Chem 1998, 72, 1779.
Rzędy wiązań – z indeksów wartościowości:
∑∑
≠
=
A B
b
ABV
Rz Rz ę ę dy wi dy wi ą ą za za ń ń (N (N - - M) M)
( )
{
( ) ( )}
− ∆ + ∆ + ∆
= ∑A
a
aa aa
A i
A n P P
V 2 2 2
2
1 α β
( ) ( )
[ ]
∑ ∑
<
∆ +
∆
=
A
a A
a
aa aa
c
A P P
V
'
2 ' 2
'
β α
b A i
AB n n
V = −∆ ∆
( ) ( )
[ ]
∑ ∑ ∆ + ∆
=
A
a B
b
ab ab
c
AB P P
V α 2 β 2
Nalewajski, R.F.; Mrozek, J.; Mazur, G. Can. J. Chem. 1996, 74, 1121.
Nalewajski, R.F.; Mrozek, J.; Michalak, A. International Journal of Quantum Chemistry 1997, 61, 589.
Nalewajski, R.F.; Mrozek, J.; Michalak, A. Polish J. Chem 1998, 72, 1779.
Rzędy wiązań – z indeksów wartościowości:
∑∑
≠
=
A B
b
ABV
Rz Rz ę ę dy wi dy wi ą ą za za ń ń (N (N - - M) M)
) (
)
(
c i BAB Bc BiAB A i
c
AB
V V w V V w V V
b =
AB+
AB+
A+
A+ +
( )
{
( ) ( )}
− ∆ + ∆ + ∆
= ∑A
a
aa aa
A i
A n P P
V 2 2 2
2
1 α β
( ) ( )
[ ]
∑ ∑
<
∆ +
∆
=
A
a A
a
aa aa
c
A P P
V
'
2 ' 2
'
β α
b A i
AB n n
V = −∆ ∆
( ) ( )
[ ]
∑ ∑ ∆ + ∆
=
A
a B
b
ab ab
c
AB P P
V α 2 β 2
Nalewajski, R.F.; Mrozek, J.; Mazur, G. Can. J. Chem. 1996, 74, 1121.
Nalewajski, R.F.; Mrozek, J.; Michalak, A. International Journal of Quantum Chemistry 1997, 61, 589.
Nalewajski, R.F.; Mrozek, J.; Michalak, A. Polish J. Chem 1998, 72, 1779.
Rzędy wiązań – z indeksów wartościowości:
∑∑
≠
=
A B
b
ABV
Rz Rz ę ę dy wi dy wi ą ą za za ń ń (N (N - - M) M)
) (
)
(
c i BAB Bc BiAB A i
c
AB
V V w V V w V V
b =
AB+
AB+
A+
A+ +
∑
=
Z
c XZ c
XY XY
X
V V
w /
• związane z prawdopodobieństwami dwulektronowymi
• podejście róznicowe – dobrze zdefiniowany atomowy układ odniesienia
• uwzględniają przyczynki kowalencyjne i jonowe
• wymagają obliczeń dla izolowanych atomów ( dla promolekuły)
• związane z prawdopodobieństwami dwulektronowymi
• podejście róznicowe – dobrze zdefiniowany atomowy układ odniesienia
• uwzględniają przyczynki kowalencyjne i jonowe
• wymagają obliczeń dla izolowanych atomów ( dla promolekuły)
Rz Rz ę ę dy wi dy wi ą ą za za ń ń (N (N - - M) M)
0.98 2.02
SZ C2H4
0.98 1.89
DZP, frozen core
0.99 1.03
SZ C2H6
C2H2
Molekuła / baza
0.96 1.01
DZP, frozen core
1.04 2.83
DZP, frozen core
0.99 2.98
SZ
BC-H BC-C
Rz Rz ę ę dy wi dy wi ą ą za za ń ń (N (N - - M) M)
0.98 (0.97) 2.02 (2.02)
SZ C2H4
0.98 1.89
DZP, frozen core
0.99 (0.98) 1.03 (1.01)
SZ C2H6
C2H2
Molecule/Basis
0.96 1.01
DZP, frozen core
1.04 2.83
DZP, frozen core
0.99 (0.99) 2.98 (2.99)
SZ
BC-H BC-C
N-M b.o (Mayer b.o.)
Rz Rz ę ę dy wi dy wi ą ą za za ń ń (N (N - - M) M)
0.98 (0.97) 2.02 (2.02)
SZ C2H4
0.98 (1.01) 1.89 (1.67)
DZP, frozen core
0.99 (0.98) 1.03 (1.01)
SZ C2H6
C2H2
Molecule/Basis
0.96 (0.99) 1.01 (0.91)
DZP, frozen core
1.04 (1.04) 2.83 (2.23)
DZP, frozen core
0.99 (0.99) 2.98 (2.99)
SZ
BC-H BC-C
N-M b.o (Mayer b.o.)
Rz Rz ę ę dy wi dy wi ą ą za za ń ń (N (N - - M) M)
0.98 (0.97) 2.02 (2.02)
SZ C2H4
0.98 (1.01) 1.89 (1.67)
DZP, frozen core
0.99 (0.98) 1.03 (1.01)
SZ C2H6
C2H2
Molecule/Basis
0.96 (0.99) 1.01 (0.91)
DZP, frozen core
1.04 (1.04) 2.83 (2.23)
DZP, frozen core
0.99 (0.99) 2.98 (2.99)
SZ
BC-H BC-C
N-M b.o (Mayer b.o.)
Rz Rz ę ę dy wi dy wi ą ą za za ń ń (N (N - - M) M)
N-M: słabszy wpływ bazy
C6H6
Molecule/Basis
0.97 (1.04) 1.38 (1.24)
DZP, frozen core
0.97 (0.96) 1.44 (1.43)
SZ
BC-H BC-C
N-M b.o (Mayer b.o.)
Rz Rz ę ę dy wi dy wi ą ą za za ń ń (N (N - - M) M)
NaCl :
Rz Rz ę ę dy wi dy wi ą ą za za ń ń (N (N - - M) M)
NaCl :
N-M: 1.10
G-J: 0.36
Mayer: 0.54
Rz Rz ę ę dy wi dy wi ą ą za za ń ń (N (N - - M) M)
H-Kr-C≡ ≡ ≡C-H: ≡
L. Kriatchev et al. JACS, 2003,125, 6875.
Rz Rz ę ę dy wi dy wi ą ą za za ń ń (N (N - - M) M)
H-Kr-C≡ ≡ ≡C-H: ≡
N-M Mayer
H-Kr: 1.10 1.41 Kr-C: 0.84 0.99
C-C: 3.02 3.07
C-H: 1.04 1.10
Rz Rz ę ę dy wi dy wi ą ą za za ń ń (N (N - - M) M)
Tlenek węgla:
CO N-M: 3.038
G-J: 2.550
Mayer: 2.162
Tlenek wegla
Układ Konfiguracja
vCORząd wiązania CO (5σ) σ) σ) σ)
22143 3.038
CO
+(5σ) σ) σ) σ)
12184 3.208
CO* (5σ) σ) σ) σ)
1(2π π π π
1) 1489,1715 2.662
Monokarbonylki metali przejściowych
Zhou, M; Andrews, L.;
Bauschlicher, C.W., Chem. Rev. 2001, 101, 1931.
2,1 2,2 2,3 2,4 2,5 2,6 2,7 2,8
Sc Ti V Cr Mn Fe Co Ni Cu
Monokarbonylki metali przejściowych
MCO+
MCO
MCO-
C -O b o n d o rd er
2,1 2,2 2,3 2,4 2,5 2,6 2,7 2,8
Sc Ti V Cr Mn Fe Co Ni Cu
MCO+
MCO
MCO-
C -O b o n d o rd er
Monokarbonylki metali przejściowych
Karbonylki metali przejściowych
Kompleks
vCORząd wiązania CO
Ni(CO)
42060 2.520
[Co(CO)
4]
-1890 2.258
[Fe(CO)
4]
-21790 2.061
d
10Kompleks
vCORząd wiązania CO
Ni(CO)
42060 2.520
[Co(CO)
4]
-1890 2.258 [Fe(CO)
4]
-21790 2.061 [Mn(CO)
6]
+2090 2.561
Mo(CO)
62010 2.467
Cr(CO)
62000 2.450
[V(CO)
6]
-1860 2.238 d
10d
6Karbonylki metali przejściowych
2 2,1 2,2 2,3 2,4 2,5 2,6 2,7
1750 1800 1850 1900 1950 2000 2050 2100 2150
CO
Bond O
rder
vCO[cm-1]
Karbonylki metali przejściowych
Ni(CO)4 Mn(CO)6+
Cr(CO)6 Mo(CO)6
Co(CO)4- V(CO)6-
Fe(CO)42-
Karbonylki metali przejściowych
R Rzad wiązania CO P(CH
3)
32.432
P(C
6H
5)
32.441 P(OCH
3)
32.445 P(OC
6H
5)
32.470 P(Cl)
32.508
P(F)
32.505
CO 2.520
Fosfiny, Ni(CO)
3R
NH3 Ni NH3 Cl
Cl
NH3 Ni Cl Cl
NH3 0.563
0.841
0.473
0.941
Wpływ trans ligandu
trans - influence
NH3 Ni R R
NH3
R Rząd wiązania Ni-N
H
-0.306
CN
-0.348 Cl
-0.473
OH- 0.486
CO 0.510
2+
Kompleksy CrO
nCl
4-n– wiązanie Cr-O
1,5 1,7 1,9 2,1 2,3
850 900 950 1000
v M-O [1/cm]
M-O bond order
[CrO4]2-
Complex v(Cr-O) b (Cr-O) [CrO4]2- 846, 890 1.65 [CrO3Cl]- 907, 954 1.85 [CrO2Cl2] 984, 994 2.02 [CrOCl3]+ 1026* 2.14
[CrO3Cl]-
[CrO2Cl2]
[CrOCl3]+
* Cr(O)Cl (TPP) value
Mo
O
O O
O
O
O
Powierzchnia (010) - MoO
31.73A 1.68A 1.94 A
1.94 A 2.25A
2.33A Dł wiązania
Model klastrowy Mo7O30H18
BALSAC plot
A. Michalak, K. Hermann, M. Witko, Surf. Sci., 366 (1996) 323-336.
K. Hermann, A. Michalak, M. Witko, Catalysis Today, 32 (1996), 321-327.
K. Hermann, M. Witko, A. Michalak, Catalysis Today, 50 (1999) 567-577.
Mo
O
O O
O
O
O
Powierzchnia (010) - MoO
31.73A 1.68A 1.94 A
1.94 A 2.25A
2.33A Dł wiązań
Model klastrowy Mo7O30H18
A. Michalak, K. Hermann, M. Witko, Surf. Sci., 366 (1996) 323-336.
K. Hermann, A. Michalak, M. Witko, Catalysis Today, 32 (1996), 321-327.
K. Hermann, M. Witko, A. Michalak, Catalysis Today, 50 (1999) 567-577.
Mo
O
O O
O
O
O
1.68 2.09 0.82
0.82 0.26
0.23 Rz. wiązań
Cr
2Cr
2- wiązanie sześciokrotne
Contour 0.3
Contour 0.05
σ σ σ
σ π π π π π π π π
MOδ δ δ δ δ δ δ δ σ σ σ σ
Contour 0.3
σ σ σ
σ π π π π π π π π
MOδ δ δ δ δ δ δ δ σ σ σ σ
Rząd wiązania:
N-M: 6.01
Cr
2- wiązanie sześciokrotne
cdn