KONFERENCJE NAUKOWE
1. 49 Zjazd PTChem i SITPChem, Gdańsk, 18-22 września 2006
V. KATEDRA MIKROBIOLOGII Kierownik: prof. dr hab. Józef Kur, prof. zw. PG
dr Beata Krawczyk, ad.
dr Elżbieta Hiszczyńska-Sawicka, ad. (url. bezpł. - staż nauk.) dr inż. Paweł Sachadyn, ad. (url. bezpł. - staż nauk.) dr inż. Radosław Pladzyk, ad.
dr inż. Hubert Cieśliński, ad.
dr inż. Rafał Piątek, ad.
dr Beata Zalewska, ad.
dr inż. Marta Wanarska, ad.
dr inż. Anna Brillowska-Dąbrowska, asyst.
dr inż. Marcin Olszewski, asyst. (od 1.03.2006) Iwona Henke, st. tech.
Marta Wieczorkowska, st. ref.
Doktoranci:
mgr inż. Katarzyna Bury mgr inż. Anna Długołęcka mgr inż. Paweł Filipkowski mgr inż. Artur Gąsior mgr inż. Lucyna Holec mgr inż. Marta Kur mgr inż. Justyna Leibner mgr inż. Małgorzata Szymańska mgr inż. Katarzyna Werbowy
Kierunki badań naukowych
Obecna działalność naukowo-badawcza to zagadnienia związane głównie z biologią moleku-larną biotechnologią medyczną i przemysłową, wykorzystujące techniki rekombinacji DNA in vitro. Realizowane badania obejmują trzy tematy:
- diagnostyka molekularna
- molekularne mechanizmy patogenności mikroorganizmów
- białka organizmów ekstremofilnych (produkcja, charakterystyka molekularna, zastoso-wanie)
W ramach tematu dotyczącego diagnostyki molekularnej realizowane są projekty konstru-owania i testkonstru-owania nowych systemów diagnostycznych opartych o różne techniki biologii mole-kularnej, w tym o technikę PCR, do identyfikacji czynników infekcyjnych takich jak wirusy, bakterie, grzyby oraz do genotypowania i różnicowania szczepów mikroorganizmów w badaniach epidemiologicznych. Ponadto, tematyka ta obejmuje konstruowanie nowych testów immunodia-gnostycznych do rozpoznawania toksoplazmozy w oparciu o własne biotechnologiczne systemy nadprodukcji i oczyszczania antygenów Toxoplasma gonidii.
Badania molekularnych mechanizmów patogenności mikroorganizmów dotyczą operonu dra uropatogennych szczepów Escherichia coli oraz wykorzystania zdobytej wiedzy w tym zakresie do konstruowania szczepionek nowej generacji opartych na chimerycznych fimbriach.
Badania białek organizmów ekstremofilnych dotyczą konstruowania biotechnologicznych systemów ekspresyjnych, opracowywania wydajnych procedur oczyszczania oraz charakterystyki molekularnej białek takich jak: termostabilne i zaadaptowane do zimna β-galaktozydazy oraz lipazy, lizostafyna, białka SSB-podobne mikroorganizmów rodzaju Thermus i Deinococcus.
ARTYKUŁY W CZASOPISMACH Z LISTY FILADELFIJSKIEJ
1. Construction, purification and functional characterization of His-tagged Candida albicans glucosamine-6-phosphate synthase expressed in Escherichia coli / Olchowy J., Kur K., Sa-chadyn P., Milewski S. // Protein Expr. a. Purif. - Vol. 46, nr 2 (2006), s. 309-315
Konstrukcja, oczyszczanie i funkcjonalna charakterystyka syntazy glukozamino-6-fosforanu z Candida albicans zawierajacej domenę polihistydylową, eksprymowanej w Escherichia
coli. AF 73757
2. Evaluation of a PCR Melting Profile technique for bacterial strain differentiation / Krawczyk B., Samet A., Leibner J., Kur J. // J. Clinical Microb. - Vol. 44, nr 7 (2006), s. 2327-2332 Ocena przydatności techniki PCR Melting Profile do różnicowania szczepów bakteryjnych.
AF 73447 3. Filipkowski P., Duraj-Thatte A., Kur J.: Novel thermostable single-stranded DNA-binding protein (SSB) from Deinococcus geothermalis // Arch. Microbiology. - Vol. 186 (2006), s.
129-137
Nowe termostabilne białko wiążące się do jednoniciowego DNA(SSB) z Deinococcus
geo-thermalis. AF 73780
4. Filipkowski P., Koziatek M., Kur J.: A highly thermostable, homodimeric single-stranded DNA-binding protein from Deinococcus radiopugnans // Extremophiles. - Vol. 10, nr 6 (2006), s. 607-614
Wysoko termostabilne, homodimeryczne białko wiążące się do jednoniciowego DNA (SSB)
z Deinococcus radiopugnans. AF 73781
5. Structure of DraD invasin from uropathogenic Escherichia coli: a dimer with swapped b-tails / Jędrzejczak R., Dauter Z., Dauter M., Piątek R., Zalewska B., Mróz M., Bury K., Nowicki B., Kur J. // Acta Crystall. Section D-Biol. Crystall. - Vol. D62 (2006), s. 157-164 Struktura inwazyny DraD uropatogennego szczepu Escherichia coli: dimer z przesuniętymi
b-ogonami. AF 73268
6. Structure of the singlestranded DNAbinding protein SSB from Thermus aquaticus / Jęd -rzejczak R., Dauter M., Dauter Z., Olszewski M., Długołęcka A., Kur J. // Acta Crystall.
Section D [online]. - Vol. 62, pt 11 (2006), s. 1407-1412
Struktura białka wiążącego jednoniciowe DNA z Thermus aquaticus. FE 73835 7. Systematic position of copepods of the genus Achtheres (Crustacea : Copepoda :
Si-phonostomatoida) parasitizing perch, Perca fluviatilis L., and zander Sander lucioperca L.) / Kempter J., Piasecki W., Wieski K., Krawczyk B. // J. Fish Diseases. - Vol. 29, nr 2 (2006), s. 103-113
Pozycja systematyczna widłonogów pasożytniczych z rodzaju Achtheres (Crustacea : Cope-poda : Siphonostomatoida) pasożytujących u okonia, Perca fluviatilis L. i sandacza, Sander
lucioperca L. AF 73485
8. The construction of bifunctional fusion proteins consisting of MutS and GFP / Stanisławska-Sachadyn A., Stanisławska-Sachadyn P., Ihle K., Sydorczuk C., Wiejacha K., Kur J. // J. Biotechnology. - Vol. 121 (2006), s. 134-143
Konstrukcja dwufunkcyjnych białek fuzyjnych składających się z MutS i GFP. AF 72546 9. Toxoplasma gondii: an evaluation of diagnostic value of recombinant antigens in a murine model / Gatkowska J., Hiszczyńska-Sawicka E., Kur J., Holec L., Długońska H. // Experi-mental Parasitology. - Vol. 114, nr 3 (2006), s. 220-227
Toxoplasma gondii: ocena użyteczności diagnostycznej antygenów rekombinantowych na
modelu mysim. AF 73194
ARTYKUŁY W INNYCH CZASOPISMACH RECENZOWANYCH
1. Escherichia coli - zapomniany patogen posocznic / Śledzińska A., Samet A., Bronk M., Rybak B., Kur J., Krawczyk B., Nowicki B. // Prz. Epidemiologiczny. - Vol. 60 (2006), s.
27-34 AR 72547
PROJEKTY BADAWCZE MNiSW Projekty zakończone:
„Otrzymywanie chimerycznych fimbrii Dr-SAG1, Dr-ROP9, Dr-GRA1 i ich zastosowanie do produkcji fimbrialnych szczepionek przeciwko toksoplazmozie”
Kierownik i główni wykonawcy badań: R. Piątek, J. Kur, A. Gąsior (Grant 2 PO6K 024 28 (zwykły), umowa nr 0417/P04/2004/27)
„Inwazyjna DraD uropatogennych szczepów Escherichia coli Dr+ - badanie struktury, funk-cji, mechanizmu transportu na powierzchnię komórki i roli w procesie polimeryzacji struk-tur fimbrialnych”
Kierownik i główni wykonawcy badań: B. Zalewska, J. Kur, K. Bury (Grant 2 PO5A 119 27, umowa nr 0613/PO5/2004/27)
„Molekularny mechanizm patogenności szczepów Escherichia coli Dr+ - badania inicjacji biogenzy fimbrii Dr i oddziaływań pomiędzy kluczowymi białkami kodowanymi przez ope-ron dra”
Kierownik i główni wykonawcy badań: J. Kur, R. Piątek, B. Zalewska, K. Bury (Grant 2 PO4A 039 27, umowa nr 0417/PO4/2004/27)
Projekty realizowane:
„Produkcja rekombinantowych białek Toxoplasma gondii (SAG4, ROP1, ROP9, GRA2, GRA4, GRA5, MAG1, MIC3) i selekcja do różnicowania fazy ostrej i przewlekłej toksopla-zmozy w testach serologicznych”
Kierownik i główni wykonawcy badań: L. Holec, E. Hiszczyńska-Sawicka, J. Kur, A. Gąsior (Grant 2 PO4B 002 29, umowa nr 0468/PO4/2005/29)
„Identyfikacja reszt aminokwasowych kanałotwórczego białka DraC oddziałowujących z kompleksem białko opiekuńcze DraB/adhezyna DraE – wyznaczenie celu molekularnego dla potencjalnych leków przeciw uropatogennym szczepom Escherichia coli”
Kierownik i główni wykonawcy badań: J. Kur, M. Kur (Grant N301 116 31/3511 promotorski, umowa nr 3511/P01/2006/31)
„Zimnolubna Estro/lipaza Pseudoalteromonas sp. 643A – oczyszczanie i charakterystyka wybranych właściwości enzymu”
Kierownik i główni wykonawcy badań: J. Kur, A. Długołęcka (Grant N302 039 31/3427 promotorski, umowa nr 3427/P01/2006/31)
„Zastosowanie nowej techniki PCR-MP w badaniach epidemiologicznych”
Kierownik i główni wykonawcy badań: B. Krawczyk
(Grant N404 078 31/3454 habilitacyjny, umowa nr 3454/P01/2006/31)
PROMOTORSTWO DOKTORANTÓW - Kur, J., prof. dr hab. (promotor)
1. Marcin Olszewski, Wydział Chemiczny PG 2. Paweł Filipkowski, Wydział Chemiczny PG
RECENZJE PRAC DOKTORSKICH - Kur J., prof.. dr hab. (rec.)
1. Wakieć R.: Antymetabolity a oporność wielolekowa komórek grzybowych, Wydział Chemiczny PG 2. Chrzanowska M.: Badania nitryfikacji w oczyszczaniu ścieków przemysłowych osadem czynnym,
Wydział Chemiczny PG
3. Hukowska-Szematowicz B.: Charakterystyka immunologiczno-genetyczna wybranych szczepów wirusa RHD (Rabbit Haemorrhagic Disease), Wydz. Nauk Przyrodniczych, Uniwersytet Szczeciński.
4. Turecka K.: Analiza oddziaływań zmodyfikowanych w regionach -35 i -10 sekwencji promotora A1 faga T7 z polimerazą RNA E. coli w procesie inicjacji transkrypcji, AMG, Wydział Farmaceutyczny
OPINIE
- Kur J., prof. dr hab.
1. (Ocena Raportu etapowego tematu nr IV.3 działalności statutowej Instytutu Oceanologii PAN w Sopo-cie za rok 2006 pt. „Badanie procesów regulacyjnych w komórkach bakterii i innych organizmów morskich oraz ich potencjalnego znaczenia biotechnologicznego, kierownik tematu: prof. dr hab. Grze-gorz Węgrzyn)
NAGRODY I WYRÓŻNIENIA
Rafał Piątek - Nagroda im. Prof. Ernesta Syma „Dla Młodego Naukowca Wydziału Chemicznego Politechniki Gdańskiej”
WSPÓŁPRACA MIĘDZYNARODOWA 1. Brookhaven National Laboratory, USA
2. Lincoln University, Animal and Food Sciences Division, Canterbury, New Zealand 3. University of Wisconsin, McArdle Laboratory for Cancer Research, USA
CZŁONKOSTWO Z WYBORU W ORGANIZACJACH NAUKOWYCH I CZŁONKOSTWO W KOMITETACH REDAKCYJNYCH CZASOPISM NAUKOWYCH
1. Kur J., prof. dr hab.
- Członek Komitetu Mikrobiologii PAN - Członek Komitetu Biotechnologii PAN
- Członek Zespołu Redakcyjnego „Acta Biochimica Polonica”
- Członek Zespołu Redakcyjnego „Environmental Biotechnology”
STOPNIE I TYTUŁY NAUKOWE UZYSKANE PRZEZ PRACOWNIKÓW KATEDRY